Der er udbredt utilfredshed og usikkerhed blandt sektorforskerne, der blev indfusioneret på universiteterne i 2007. En ny undersøgelse viser, at vilkårene for forskning og myndighedsbetjening er blevet dårligere. I 2007 blev bl.a. Statens Byggeforskningsinstitut en del af Aalborg Universitet. Arbejdsmiljøinstituttet (nu NFA), Socialforskningsinstituttet (SFI), Statens Serum Institut (SSI), Kennedy-instituttet (KISØ) og GEUS forblev selvstændige.