• Fredrik Bajers Vej 7H

    9220 Aalborg

    Danmark

Publikationer 1995 2019

Filter
Bidrag til bog/antologi
1999

Influence of microbial activity on the stability of activated sludge flocs

Wilen, B. M., Nielsen, J. L., Keiding, K. & Nielsen, P. H., 1 dec. 1999, Influence of microbial activity on the stability of activated sludge flocs. 1541 udg. s. 1-18 18 s. (Doktorsavhandlingar vid Chalmers Tekniska Hogskola).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

anoxic conditions
microbial activity
activated sludge
iron-reducing bacterium
nitrate
2001

Biotechnology in Denmark

Pedersen, L. H., 2001, BioCommerce Data's Biotechnology Company Compendium. Helen Smith (ed.) (red.). Richmond: Surrey

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

2002

Folding of the a-helical membrane proteins DsbB and NhaA

Otzen, D., 2002, Biophysical Chemistry : Membranes and Proteins. Sedden, J. (ed.) (red.). London: Royal Society of Chemistry

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

2004

Plant chromosomal high mobility group (HMG) proteins of the HMGA and the HMGB families

Lichota, J., Grønlund, J. T., Lauenholt, D. & Grasser, K. D., 2004, Recent Res. Dev. Agronomy & Horticulture. s. 135-155 11 s. (Recent Res. Dev. Agronomy & Horticulture; Nr. 1).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

2005
1 Citation (Scopus)

Phosphorylation-specific analysis strategies for Mass Spectrometry: Enhanced detection of phosphorylated proteins and peptides

Stensballe, A., 2005, Proteomics & Peptidomics. Marko-Varga, G. (red.). Amsterdam: Pergamon Press, s. 277-351 74 s. (Wilson & Wilson's Comprehensive Analytical Chemistry, Bind 46).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

2006

Chromatin-associated architectural HMGA and HMGB proteins assist transcription factor function

Grasser, K. D. & Launholt, D., 2006, Regulation of Transcription in Plants. Grasser, K. D. (red.). Oxford, UK: IEEE Press, (Annual Plant Reviews, Bind 29).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

Generating Unigene collections of EST sequences for use in MS identification

Emmersen, J., 2006, Mass Spectrometry Data Analysis in Proteomics: Methods in Molecular Biology. Matthiesen, R. (red.). Totowa, N.J.: Humana Press, (Methods in Molecular Biology; Nr. 367).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

2008

5’-and 3’-RACE from LongSAGE tags.

Nielsen, K. L., 2008, Serial Analysis of Gene Expression (SAGE) – Methods and protocols. Nielsen, K. L. & Walker, J. M. (red.). Totowa, New Jersey, USA: Humana Press, s. 109-119 (Methods in Molecular Biology; Nr. 387).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

9 Citationer (Scopus)

DeepSAGE-Higher Sensitivity and Multiplexing of Samples Using a Simpler Experimental Protocol

Nielsen, K. L., 2008, Serial Analysis of Gene Expression (SAGE) – Methods and Protocols. Nielsen, K. L. & Walker, J. M. (red.). Totowa, New Jersey, USA: Humana Press, s. 81-93 13 s. (Methods in Molecular Biology; Nr. 387).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

6 Citationer (Scopus)

DeepSAGE – tag based transcriptome analysis beyond microarrays.

Nielsen, K. L., Petersen, A. H. & Emmersen, J., 2008, Next generation genome sequencing - towards personalized medicine. Janitz, M. (red.). Berlin, Germany: Wiley-VCH

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

1 Citation (Scopus)

Extraction and Annotation of SAGE tags using Sequence Quality values

Emmersen, J., 2008, Methods in Molecular Biology: Serial Analysis of Gene Expression (SAGE) – Digital Gene Expression Profiling. Nielsen, K. L. (red.). Humana Press

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

Low Cost Medium Throughput Sanger Dideoxy-Sequencing.

Nielsen, K. L., 2008, Methods in molecular biology: Serial Analysis of Gene Expression (SAGE) – Methods and Protocols.. Nielsen, K. L. & Walker, J. M. (red.). Totowa, New Jersey, USA: Humana Press, Bind 387. s. 71-80 10 s. (Methods in Molecular Biology; Nr. 387).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

2009
1 Citation (Scopus)

Activity and stability of proteases in hydrophilic solvents

Pedersen, L. H., Ritthitham, S. & Kristensen, M., 2009, Modern Biocatalysis: Stereo selective and environmentally friendly reactions. Fessner, W-D. & Anthonsen, T. (red.). 1 udg. Weinheim: Wiley-VCH, s. 55-66 11 s.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

Identification and quantification of microorganisms in activated sludge and biofilms by FISH: Introduction

Nielsen, P. H., Lemmer, H. & Daims, H., 2009, FISH Handbook for Biological Wastewater Treatment. Halkjær Nielsen, P., Daims, H. & Lemmer, H. (red.). 1 udg. London: IWA Publishing, s. 1-8

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

Identification of denitrifying microorganisms in activated sludge by FISH

Nielsen, J. L. & Hansen, A. A., 2009, FISH handbook for Biological Wastewater Treatment: Identification and quantification of microorganisms in activated sludge and biofilms by FISH. Nielsen, P., Daims, H. & Lemmer, H. (red.). 1 udg. London: IWA Publishing, s. 19-24

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

IDENTIFICATION OF FILAMENTOUS BACTERIA BY FISH

Kragelund, C., Müller, E., Schade, M., Thi, T. H. N., Lemmer, H., Seviour, R. & Nielsen, P. H., 2009, FISH Handbook for Biological Wastewater Treatment: Identification and quantification of microorganisms in activated sludge and biofilms by FISH. Halkjaer Nielsen, P., Daims, H. D. & Lemmer, H. (red.). London: IWA Publishing, s. 33-68

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

Identification of other microorganisms in activated sludge and biofilms by FISH

Nielsen, P. H. & Nielsen, J. L., 2009, FISH Hanbook for Biological Wastewater Treatment: Identification and quantification of microorganisms in activated sludge and biofilms by FISH. Nielsen, P., Daims, H. & Lemmer, H. (red.). 1 udg. London: IWA Publishing, s. 69-71

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

Identification of Polyphosphate-accumulating and glycogen-accumulating organisms by fish

Nielsen, P. H., Thi, T. H. N., McIlroy, S. J., Mielczarek, A. T. & Seviour, R., 2009, FISH Handbook for Biological Wastewater Treatment: Identification and quantification of microorganisms in activated sludge and biofilms by FISH. Halkjaer Nielsen, P., Daims, H. & Lemmer, H. (red.). IWA Publishing, s. 25-32

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

Protocol for Fluorescence in situ hybridization (FISH) with rRNA-targeted oligonucleotides

Nielsen, J. L., 2009, FISH Hanbook for Biological Wastewater Treatment: Identification and quantification of microorganisms in activated sludge and biofilms by FISH. Nielsen, P., Daims, H. & Lemmer, H. (red.). 1 udg. London: IWA Publishing, s. 73-84

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

2010

Microautoradiography (MAR)

Nielsen, P. H. & Nielsen, J. L., 2010, Microbial Ecology of Activated Sludge. Seviour, R. & Nielsen, P. H. (red.). London: IWA Publishing, s. 393-397 5 s.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

MICROBIAL COMMUNITIES IN ACTIVATED SLUDGE PLANTS

Seviour, R. J. & Nielsen, P. H., 2010, Microbial Ecology of Activated Sludge. IWA Publishing, s. 95-126 31 s.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

MICROBIOLOGY OF BULKING

Wanner, J., Kragelund, C. & Nielsen, P. H., 2010, Microbial Ecology of Activated Sludge. Seviour, R. & Nielsen, P. H. (red.). London: IWA Publishing, s. 191-214 24 s.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

2011

Functional bacterial amyloids in biofilms

Nielsen, P. H., Dueholm, M. S., Thomsen, T. R., Nielsen, J. L. & Otzen, D., 2011, Biofilm Highlights, Springer Series on Biofilms. Flemming, H-C., Szewzyk, U. & Wingender, J. (red.). Berlin: Springer, Bind 5. s. 41-62 22 s.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

Influence of Microorganisms on the Healing of Skin Grafts from Chronic Venous Leg Wounds, Skin Grafts - Indications, Applications and Current Research

Wolff, T. Y., Bjarnsholt, T., Kirketerp-Møller, K. & Thomsen, T. R., 2011, Skin Grafts - Indications, Applications and Current Research. Spear, M. (red.). INTECH

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

9 Citationer (Scopus)

The role of bacterial biofilms in infections of catheters and shunts

Thomsen, T. R., Hall-Stoodley, L., Moser, C. & Stoodley, P., 2011, Biofilm Infections. Springer, s. 91-109 19 s.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

Infection
Biofilm
Stomach
Medication
2012

Improved Diagnosis of Biofilm Infections Using Various Molecular Methods

Thomsen, T. R., Xu, Y., Lorenzen, J., Nielsen, P. H. & Schønheyder, H. C., 2012, Culture Negative Orthopedic Biofilm Infections. Berlin: Springer, s. 29-41 (Springer Series on Biofilms, Bind 7).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

25 Citationer (Scopus)

Targeted gene replacement in fungal pathogens via agrobacterium tumefaciens-mediated transformation

Frandsen, R. J. N., Frandsen, M. & Giese, H., 1 jan. 2012, Plant Fungal Pathogens: Methods and Protocols. Bolton, M. D. & Thomma, B. P. H. J. (red.). Springer Publishing Company, s. 17-45 29 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 835).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

Pathogens
Cloning
Genes
Network protocols
Fusion reactions
2 Citationer (Scopus)

Using UV light to engineer biosensors for cancer detection: the case of prostate specific antigen

Neves-Petersen, M. T., Parracino, A. & Petersen, S. B., 2012, Biosensors and Cancer. Preedy, V. R. & Patel, V. B. (red.). Science Publishers, s. 378-394

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

UV light effects on proteins: from photochemistry to nanomedicine

Neves-Petersen, M. T., Gajula, G. P. & Petersen, S. B., 2012, Molecular Photochemistry: Various Aspects. Saha, S. (red.). INTECH, s. 125-158

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

2013
10 Citationer (Scopus)

Functional Amyloids in Bacteria

Dueholm, M. S., Nielsen, P. H., Chapman, M. & Otzen, D., 27 jan. 2013, Amyloid Fibrils and Prefibrillar Aggregates: Molecular and Biological Properties. Otzen, D. E. (red.). Wiley-VCH, s. 411-438 28 s.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

Growth in photobioractors

Eriksen, N. T., 2013, Natural and artificial photosynthesis. Razeghifard, R. (red.). Wiley, s. 285-305 21 s.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

1 Citation (Scopus)

Heterotrophic Microalgae in Biotechnology

Eriksen, N. T., 2013, Microalgae: biotechnology, Microbiology and Energy. Johansen, M. N. (red.). Nova Science Publishers, s. 387-412 26 s. (Marien Biology).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

Odlade mikroalger till mat - fortfarende in sin linda

Eriksen, N. T., 2013, Havsbruk som håller i längden. Johansson, B. (red.). Stockholm: Forskningsrådet för miljö, areella näringar och samhällsbyggande, Formas, s. 201-211 11 s.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiFormidling

2014
39 Citationer (Scopus)

The Family Saprospiraceae

McIlroy, S. J. & Nielsen, P. H., 2014, The Prokaryotes: Other Major Lineages of Bacteria and The Archaea. Rosenberg, E., Delong, E. F., Lory, S., Stackebrandt, E. & Thompson, F. (red.). 4 udg. Heidelberg: Springer Science+Business Media, Bind 11. s. 863-889 27 s.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

activated sludge
gliding
aquatic environment
hydrolysis
organic compound
2015

Fungal NRPS-dependent siderophores: from function to prediction

Sørensen, J. L., Knudsen, M., T. Hansen, F., Olesen, C., Romans Fuertes, P., V. Lee, T., Søndergaard, T. E., Pedersen, C. S., Brodersen, D. E. & Giese, H., 2015, Biosynthesis and Molecular Genetics of Fungal Secondary Metabolites. Springer Publishing Company, s. 317-339 (Fungal Biology).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

Studies of the Ecophysiology of Single Cells in Microbial Communities by (Quantitative) Microautoradiography and Fluorescence In Situ Hybridization (MAR-FISH)

Nierychlo, M., Nielsen, J. L. & Nielsen, P. H., 22 mar. 2015, Hydrocarbon and Lipid Microbiology Protocols: Ultrastructure and Imaging. McGenity, T. J., Timmis, K. N. & Nogales, B. (red.). Springer, s. 115-130 (Springer Protocols Handbooks).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

Fluorescence
Image analysis
Ecosystems
Microscopic examination
Sampling
2016

Amyloids – a neglected child of the slime

Dueholm, M. S. & Nielsen, P. H., 2016, The Perfect Slime: Microbial Extracellular Polymeric Substances (EPS). Flemming, H-C., Neu, T. R. & Wingender, J. (red.). London: IWA Publishing, s. 113-133 21 s.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

Microscopy

Bidragets oversatte titel: MikroskopiNielsen, J. L., Seviour, R. & Nielsen, P. H., 25 apr. 2016, Experimental Methods in Wastewater Treatment. C. M. van Loosdrecht, M., Halkjær Nielsen, P., M. Lopez-Vazquez, C. & Brdjanovic, D. (red.). IWA Publishing, s. 263-284 22 s. (Water Intelligence Online, Bind 15).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

Molecular methods

Karst, S. M., Albertsen, M., Kirkegaard, R. H., Dueholm, M. S. & Nielsen, P. H., 2016, Experimental methods in wastewater treatment. van Loosdrecht, M. C. M., Halkjær Nielsen, P., Lopez-Vazquez, C. M. & Brdjanovic, D. (red.). IWA Publishing, s. 285-324 39 s. (Water Intelligence Online).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

2018

Heterotrophic Production of Phycocyanin in Galdieria sulphuraria

Eriksen, N. T., 2018, Extremophiles: From Biology to Biotechnology. Durvasula, R. V. & Subba Rao, D. V. (red.). 1 udg. CRC Press, s. 87-101 16 s.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

Sulfur-34S and 36S Stable Isotope Labeling of Amino Acids for Quantification (SULAQ34/36) of Proteome Analyses

Herbst, F-A., Jehmlich, N., von Bergen, M. & Schmidt, F., 2018, Microbial Proteomics: Methods and Protocols. Becher, D. (red.). Springer, s. 163-174 12 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 1841).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

2019

Caenorhabditis elegans and mass spectrometry as tools to study probiotics and host response

Hesselager, M. O., Mørch, M. G. M., Møller, K. V., Harders, R. H., Bendixen, E. & Olsen, A., jun. 2019, Caenorhabditis elegans and mass spectrometry as tools to study probiotics and host response.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskning

1 Citation (Scopus)

Climate change impacts on mountain biodiversity

Guisan, A., Broennimann, O., Buri, A., Cianfrani, C., D'Amen, M., Di Cola, V., Fernandes, R., Gray, S., Mateo, R. G., Pinto, E., Pradervand, J-N., Scherrer, D., von Däniken, I., Yashiro, E. & Vittoz, P., jan. 2019, Biodiversity and Climate Change. Yale University Press, s. 221-233 13 s.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

biodiversity
climate change
mountain
extinction risk
climate