• Fredrik Bajers Vej 7H

    9220 Aalborg

    Danmark

Publikationer 1995 2019

Filter
Tidsskriftartikel
2013
57 Citationer (Scopus)

Insights from quantitative metaproteomics and protein-stable isotope probing into microbial ecology

von Bergen, M., Jehmlich, N., Taubert, M., Vogt, C., Bastida, F., Herbst, F-A., Schmidt, F., Richnow, H-H. & Seifert, J., okt. 2013, I : I S M E Journal. 7, 10, s. 1877-85 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

microbial ecology
Ecology
Isotopes
stable isotopes
stable isotope
9 Citationer (Scopus)

Limitations in detection of (15)N incorporation by mass spectrometry in protein-based stable isotope probing (protein-SIP)

Taubert, M., von Bergen, M. & Seifert, J., maj 2013, I : Analytical and Bioanalytical Chemistry. 405, 12, s. 3989-3996 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Isotopes
Mass spectrometry
Proteins
Peptides
Nitrogen
55 Citationer (Scopus)

Link between microbial composition and carbon substrate-uptake preferences in a PHA-storing community

Albuquerque, M. G. E., Carvalho, G., Kragelund, C., Silva, A. F., Barreto Crespo, M. T., Reis, M. A. M. & Nielsen, P. H., 1 jan. 2013, I : ISME Journal. 7, 1, s. 1-12 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

43 Citationer (Scopus)

Metabolic model for the filamentous ‘Candidatus Microthrix parvicella’ based on genomic and metagenomic analyses

McIlroy, S. J., Kristiansen, R., Albertsen, M., Karst, S. M., Rossetti, S., Nielsen, J. L., Tandoi, V., Seviour, R. J. & Nielsen, P. H., 2013, I : I S M E Journal. 7, 6, s. 1161-1172 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Metagenomics
Waste Water
genomics
Fatty Acids
Metagenome
40 Citationer (Scopus)

Metabolic versatility in full-scale wastewater treatment plants performing enhanced biological phosphorus removal

Lanham, A. B., Oehmen, A., Saunders, A. M., Carvalho, G., Nielsen, P. H. & Reis, M. A. M., 1 dec. 2013, I : Water Research. 47, 19, s. 7032-7041 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

7 Citationer (Scopus)

Metagenomes obtained by "deep sequencing" - what do they tell about the EBPR communities?

Albertsen, M., Saunders, A. M., Nielsen, K. L. & Nielsen, P. H., 2013, I : Water Science and Technology. 68, 9, s. 1959-1968 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Phosphorus
phosphorus
Microorganisms
genomics
DNA
35 Citationer (Scopus)

Microbial minorities modulate methane consumption through niche partitioning

Bodelier, P. L. E., Meima-Franke, M., Hordijk, C. A., Steenbergh, A. K., Hefting, M. M., Bodrossy, L., Von Bergen, M. & Seifert, J., 1 nov. 2013, I : ISME Journal. 7, 11, s. 2214-2228 15 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

25 Citationer (Scopus)

Mixotrophic continuous flow cultivation of Chlorella Protothecoides for lipids

Wang, Y., Rischer, H., Eriksen, N. T. & Wiebe, M., 2013, I : Bioresource Technology. 144, s. 608-614 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

5 Citationer (Scopus)

Performance Comparison of Affymetrix SNP6.0 and Cytogenetic 2.7M Whole-Genome Microarrays in Complex Cancer Samples

Bødker, J. S., Nielsen, C. G., Johansen, P., Schmitz, A., Madsen, J., Johnsen, H. E., Bøgsted, M., Dybkær, K. & Nyegaard, M., 2013, I : Cytogenetic and Genome Research. 139, 2, s. 80-87 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Cytogenetics
Genome
Neoplasms
Loss of Heterozygosity
Neoplasm Genes
104 Citationer (Scopus)

Population dynamics of bacteria involved in enhanced biological phosphorus removal in Danish wastewater treatment plants

Mielczarek, A. T., Nguyen, H. T. T., Nielsen, J. L. & Nielsen, P. H., 2013, I : Water Research. 47, 4, s. 1529-1544 15 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

15 Citationer (Scopus)

Production of fusarielins by Fusarium

Sørensen, J. L., Akk, E., Thrane, U., Giese, H. & Søndergaard, T., 2013, I : International Journal of Food Microbiology. 160, 3, s. 206-211 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

17 Citationer (Scopus)

Protein Conformational Change Delayed by Steric Hindrance from an N-Linked Glycan

Bager, R., Johansen, J. S., Jensen, J. K., Stensballe, A., Jendroszek, A., Buxbom, L., Sørensen, H. P. & Andreasen, K. P., 20 maj 2013, I : Journal of Molecular Biology. 425, 16, s. 2867–2877

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Plasminogen Activator Inhibitor 1
Polysaccharides
Zebrafish
Serpins
Proteins
28 Citationer (Scopus)

Purification of the photosynthetic pigment C-phycocyanin from heterotrophic Galdieria sulphuraria

Sørensen, L., Hankte, A. & Eriksen, N. T., 2013, I : Journal of the Science of Food and Agriculture. 93, 12, s. 2933-2938 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

5 Citationer (Scopus)

Pyruvate kinase and phosphopyruvate hydratase as novel IgE reactive proteins in prawn

Tomm, J. M., Krause, C., Simon, J. C., Treudler, R., von Bergen, M. & Averbeck, M., 15 nov. 2013, I : Journal of Investigational Allergology and Clinical Immunology. 23, 6, s. 443-445 3 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

På vej til at mindske fouling i membranbioreaktorer (MBR)

Larsen, P., Christensen, M. L. & Nielsen, P. H., 2013, I : Spildevandsteknisk Tidsskrift. 41, 4, s. 34-35

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

29 Citationer (Scopus)

Quantitative proteomic analysis of ibuprofen-degrading Patulibacter sp. strain I11

Almeida, B., Kjeldal, H., Lolas, I. B. Y., Knudsen, A. D., Carvalho, G., Nielsen, K. L., Barreto Crespo, M. T., Stensballe, A. & Nielsen, J. L., sep. 2013, I : Biodegradation. 24, 5, s. 615-630 16 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

44 Citationer (Scopus)

Real-Time Optical Antimicrobial Susceptibility Testing

Fredborg, M., Andersen, K. R., Jørgensen, E., Droce, A., Olesen, T., Jensen, B. B., Rosenvinge, F. S. & Søndergaard, T., 17 apr. 2013, I : Journal of Clinical Microbiology. 51, 7, s. 2047-2053

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

717 Citationer (Scopus)

Sex differences in the gut microbiome drive hormone-dependent regulation of autoimmunity

Markle, J. G. M., Frank, D. N., Mortin-Toth, S., Robertson, C. E., Feazel, L. M., Rolle-Kampczyk, U., von Bergen, M., McCoy, K. D., Macpherson, A. J. & Danska, J. S., 1 mar. 2013, I : Science. 339, 6123, s. 1084-1088 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Gonadal Steroid Hormones
Autoimmunity
Type 1 Diabetes Mellitus
Sex Characteristics
Hormones
3 Citationer (Scopus)

Study of the tryptophan-terbium FRET pair coupled to silver nanoprisms for biosensing applications

Gennaro, A. K. D., Gurevich, L., Skovsen, E., Overgaard, M. T. & Fojan, P., 14 jun. 2013, I : Physical Chemistry Chemical Physics. 15, s. 8838-8844

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Terbium
terbium
tryptophan
Silver
Tryptophan
13 Citationer (Scopus)

Subtoxic and toxic concentrations of benzene and toluene induce Nrf2-mediated antioxidative stress response and affect the central carbon metabolism in lung epithelial cells A549

Murugesan, K., Baumann, S., Wissenbach, D. K., Kliemt, S., Kalkhof, S., Otto, W., Mögel, I., Kohajda, T., von Bergen, M. & Tomm, J. M., 1 nov. 2013, I : Proteomics. 13, 21, s. 3211-3221 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

38 Citationer (Scopus)

Sulfated hyaluronan containing collagen matrices enhance cell-matrix-interaction, endocytosis, and osteogenic differentiation of human mesenchymal stromal cells

Kliemt, S., Lange, C., Otto, W., Hintze, V., Möller, S., von Bergen, M., Hempel, U. & Kalkhof, S., 4 jan. 2013, I : Journal of Proteome Research. 12, 1, s. 378-389 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Hyaluronic Acid
Endocytosis
Mesenchymal Stromal Cells
Cell Communication
Bone
13 Citationer (Scopus)

Sulfur-34S stable isotope labeling of amino acids for quantification (SULAQ34) of proteomic changes in Pseudomonas fluorescens during naphthalene degradation

Herbst, F-A., Taubert, M., Jehmlich, N., Behr, T., Schmidt, F., Bergen, M. V. & Seifert, J., 2013, I : Molecular and Cellular Proteomics. 12, 8, s. 2060-2069 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Sulfur Isotopes
Isotope Labeling
Pseudomonas fluorescens
Sulfur
Isotopes
20 Citationer (Scopus)

Synthetic analogs of anoplin show improved antimicrobial activities

Munk, J., Uggerhøj, L. E., Poulsen, T. J., Frimodt-Møller, N., Wimmer, R., Nyberg, N. & Hansen, P. R., 2013, I : Journal of Peptide Science. 19, 11, s. 669-675

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

23 Citationer (Scopus)
22 Citationer (Scopus)

The fungal symbiont of Acromyrmex leaf-cutting ants expresses the full spectrum of genes to degrade cellulose and other plant cell wall polysaccharides

Grell, M. N., Linde, T., Nygaard, S., Nielsen, K. L., Boomsma, J. J. & Lange, L., 28 dec. 2013, I : B M C Genomics. 14, 11 s., 928.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

18 Citationer (Scopus)
Population dynamics
Wastewater treatment
Nutrients
activated sludge
population dynamics
11 Citationer (Scopus)

The nitrogen cycle in anaerobic methanotrophic mats of the Black Sea is linked to sulfate reduction and biomass decomposition

Siegert, M., Taubert, M., Seifert, J., von Bergen, M., Basen, M., Bastida, F., Gehre, M., Richnow, H. H. & Krüger, M., 1 nov. 2013, I : FEMS Microbiology Ecology. 86, 2, s. 231-245 15 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

13 Citationer (Scopus)

Two-dimensional proteome reference map of Prototheca zopfii revealed reduced metabolism and enhanced signal transduction as adaptation to an infectious life style

Murugaiyan, J., Weise, C., von Bergen, M. & Roesler, U., sep. 2013, I : Proteomics. 13, 17, s. 2664-2669 6 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Prototheca
Signal transduction
Proteome
Metabolism
Life Style
2012
143 Citationer (Scopus)

A metagenome of a full-scale microbial community carrying out Enhanced Biological Phosphorus Removal

Albertsen, M., Hansen, L. B. S., Saunders, A. M., Nielsen, P. H. & Nielsen, K. L., jun. 2012, I : I S M E Journal. 6, s. 1094-1106

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Metagenome
Phosphorus
microbial communities
microbial community
phosphorus
1 Citation (Scopus)

A model system for assessing and comparing the ability of exon microarray and tag sequencing to detect genes specific for malignant B-cells

Kloster, M. B., Bilgrau, A. E., Rodrigo, M., Bergkvist, K. S., Schmitz, A., Sønderkær, M., Bødker, J. S., Larsen, S. F., Nyegaard, M., Johnsen, H. E., Nielsen, K. L., Dybkær, K. & Bøgsted, M., 2012, I : B M C Genomics. 13, 596, s. 1-13 596.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

25 Citationer (Scopus)

A study of the prevalence of sicca symptoms and secondary Sjögren's syndrome in patients with rheumatoid arthritis, and its association to disease activity and treatment profile

Haga, H-J., Moreno, A. M., Naderi, Y. & Peen, E., 1 jun. 2012, I : International Journal of Rheumatic Diseases. 15, 3, s. 284-288 5 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Rheumatoid Arthritis
Cross-Sectional Studies
Therapeutics
Saliva
amsonic acid
20 Citationer (Scopus)

Bacterial Diversity in Suspected Prosthetic Joint Infections: An Exploratory Study Using 16S rRNA Gene Analysis

Xu, Y., Rudkjøbing, V. B., Simonsen, O., Pedersen, C., Lorenzen, J., Schønheyder, H. C., Nielsen, P. H. & Thomsen, T. R., 2012, I : F E M S Immunology and Medical Microbiology. 65, 2, s. 291-304 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Biomass composition of blue mussels, Mytilus edulis, is affected by living site and species of ingested microalgae

Pleissner, D., Eriksen, N. T., Lundgreen, K. & Riisgård, H. U., 2012, I : ISRN Zoology. 2012, 902152, s. 1-12 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

39 Citationer (Scopus)

Candidatus ‘Halomonas phosphatis’, a Novel Polyphosphate-Accumulating Organism in Full-Scale Enhanced Biological Phosphorus Removal Plants

Nguyen, H. T. T., Nielsen, J. L. & Nielsen, P. H., 2012, I : Environmental Microbiology. 14, 10, s. 2826-2837 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

19 Citationer (Scopus)

Community structure of bacteria and fungi in aerosols of a pig confinement building

Kristiansen, A., Saunders, A. M., Hansen, A. A., Nielsen, P. H. & Nielsen, J. L., 2012, I : FEMS Microbiology Ecology. 80, 2, s. 390-401 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

13 Citationer (Scopus)

Comparative proteomic analysis of casein and whey as prepared by chymosin-induced separation, isoelectric precipitation or ultracentrifugation

Jensen, H. B., Poulsen, N. A., Møller, H. S., Stensballe, A. & Larsen, L. B., 2012, I : Journal of Dairy Research. 79, 4, s. 451-458 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Chymosin
chymosin
ultracentrifugation
Ultracentrifugation
Caseins
19 Citationer (Scopus)

Culture-Dependent and -Independent Investigations of Microbial Diversity on Urinary Catheters

Xu, Y., Moser, C., Al-Soud, W. A., Sørensen, S., Høiby, N., Nielsen, P. H. & Thomsen, T. R., 2012, I : Journal of Clinical Microbiology. 50, 12, s. 3901-3908 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

61 Citationer (Scopus)

Curli functional amyloid systems are phylogenetically widespread and display large diversity in operon and protein structure

Dueholm, M. S., Albertsen, M., Otzen, D. & Nielsen, P. H., 2012, I : P L o S One. 7, 12, 10 s., e51274.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

17 Citationer (Scopus)

Digital gene expression profiling of primary acute lymphoblastic leukemia cells

Nordlund, J., Kiialainen, A., Karlberg, O., Berglund, E. C., Göransson-Kultima, H., Sønderkær, M., Nielsen, K. L., Gustafsson, M. G., Behrendtz, M., Forestier, E., Perkkiö, M., Söderhäll, S., Lönnerholm, G. & Syvänen, A-C., 2012, I : Leukemia. 26, s. 1218-1227

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

40 Citationer (Scopus)
15 Citationer (Scopus)

Electrochemical sandwich assay for attomole analysis of DNA and RNA from beer spoilage bacteria Lactobacillus brevis

Shipovskov, S., Saunders, A. M., Nielsen, J. S., Hansen, M. H., Gothelf, K. V. & Ferapontova, E., aug. 2012, I : Biosensors and Bioelectronics. 37, 1, s. 99-106 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Lactobacillus brevis
Spoilage
Beer
RNA
Assays
8 Citationer (Scopus)

Estrogenic effects of fusarielins in human breast cancer cell lines.

Søndergaard, T., G. Klitgaard, L., Purup, S., Kobayashic, H., Giese, H. & Sørensen, J. L., 15 nov. 2012, I : Toxicology Letters. 214, 3, s. 259-262

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

45 Citationer (Scopus)

Eurocin, a New Fungal Defensin: Structure, lipid binding and its mode of action

Øemig, J. S., Lynggaard, C., Knudsen, D. H., Hansen, F. T., Nørgaard, K. D., Schneider, T., Vad, B. S., Sandvang, D., Nielsen, L. A., Neve, S., Kristensen, H-H., Sahl, H-G., Otzen, D. & Wimmer, R., 7 dec. 2012, I : Journal of Biological Chemistry. 287, 50, s. 42361-42372

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

2 Citationer (Scopus)

Functional Proteomic Analysis of Long-term Growth Factor Stimulation and Receptor Tyrosine Kinase Coactivation in Swiss 3T3 Fibroblasts

Nagano, K., Akpan, A., Warnasuriya, G., Corless, S., Totty, N., Yang, A., Stein, R., Zvelebil, M., Stensballe, A., Burlingame, A., Waterfield, M., Cramer, R., Timms, J. F. & Hansen, S. N., dec. 2012, I : Molecular and Cellular Proteomics. 11, 12, s. 1690-1708 19 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Growth Factor Receptors
Receptor Protein-Tyrosine Kinases
Fibroblasts
Proteomics
Protein-Tyrosine Kinases

Får kartofler en større rolle i fremtidens landbrug?

Nielsen, K. L., feb. 2012, I : Dansk kartoffelstivelse. 21, 1, s. 10-13 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

2 Citationer (Scopus)

Glycosylations and truncations of functional cereal phytases expressed and secreted by Pichia pastoris documented by mass spectrometry

Dionisio, G., Jørgensen, M., Welinder, K. G. & Brinch-Pedersen, H., 2012, I : Protein Expression and Purification. 82, 1, s. 179-185 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

7 Citationer (Scopus)
896 Downloads (Pure)

Grafting cyclodextrins to calcium phosphate ceramics for biomedical applications

Jacobsen, P. A. L., Nielsen, J. L., Juhl, M. V., Theilgaard, N. & Larsen, K. L., 1 feb. 2012, I : Journal of Inclusion Phenomena and Macrocyclic Chemistry. 72, 1-2, s. 173-181 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Fil
23 Citationer (Scopus)

Identification of glucose-fermenting bacteria in a full-scale enhanced biological phosphorus removal plant by stable isotope probing

Nielsen, J. L., Nguyen, H. T. T., Meyer, R. L. & Nielsen, P. H., 2012, I : Microbiology. 158, 7, s. 1818-1825 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

20 Citationer (Scopus)

Identification of triclosan-degrading bacteria using stable isotope probing, fluorescence in situ hybridization and microautoradiography

Lolas, I. B. Y., Chen, X., Bester, K. & Nielsen, J. L., 2012, I : Microbiology. 158, 11, s. 2796-2804 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

20 Citationer (Scopus)

Interactions of cyclodextrins with aromatic amino acids: A basis for protein interactions

Aachmann, F. L., Larsen, K. L. & Wimmer, R., 2012, I : Journal of Inclusion Phenomena and Macrocyclic Chemistry. 73, 1-4, s. 349-357

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Aromatic Amino Acids
cyclodextrins
Cyclodextrins
aromatic compounds
amino acids