• Fredrik Bajers Vej 7, H, 3-505

    9220 Aalborg

    Danmark

  • Fredrik Bajers Vej 7H

    9220 Aalborg

    Danmark

20062022
Hvis du har foretaget ændringer i Pure, vil de snart blive vist her.

Publikationer 2006 2019

10 Citationer (Scopus)

Extracellular polymeric substances of biofilms: Suffering from an identity crisis

Seviour, T., Derlon, N., Dueholm, M. S., Flemming, H-C., Girbal-Neuhauser, E., Horn, H., Kjelleberg, S., van Loosdrecht, M. C. M., Lotti, T., Malpei, M. F., Nerenberg, R., Neu, T. R., Paul, E., Yu, H. & Lin, Y., 15 mar. 2019, I : Water Research. 151, s. 1-7 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

1 Citation (Scopus)

The Proteome of Tetrasphaera elongata is adapted to Changing Conditions in Wastewater Treatment Plants

Herbst, F-A., Dueholm, M. S., Wimmer, R. & Nielsen, P. H., 25 apr. 2019, I : Proteomes. 7, 2, s. 1-11 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
2018
5 Downloads (Pure)

Development of bipolar prosthecae by candidate phylum Acetothermia bacteria

Hao, L., McIlroy, S. J., Kirkegaard, R. H., Karst, S. M., Fernando, E., Aslan, H., Meyer, R., Albertsen, M., Nielsen, P. H. & Dueholm, M. S., 16 aug. 2018.

Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskriftPosterForskning

Åben adgang
Fil
8 Citationer (Scopus)
10 Downloads (Pure)

Ecology and Biogenesis of Functional Amyloids in Pseudomonas

Rouse, S. L., Matthews, S. J. & Dueholm, M. S., 12 okt. 2018, I : Journal of Molecular Biology. 430, 20, s. 3685-3695 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftReview (oversigtsartikel)Forskningpeer review

Åben adgang
Fil
Pseudomonas
Ecology
Amyloid
Biofilms
Bacteria

Functional amyloids in biofilms

Dueholm, M. S., 2018.

Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskriftKonferenceabstrakt til konferenceForskning

4 Citationer (Scopus)
115 Downloads (Pure)

Genomic and in Situ Analyses Reveal the Micropruina spp. as Abundant Fermentative Glycogen Accumulating Organisms in Enhanced Biological Phosphorus Removal Systems

McIlroy, S. J., Carvallo, C. A. O., McIlroy, B., Herbst, F-A., Dueholm, M. S., Kirkegaard, R. H., Warnakulasuriya, E. Y. F., Karst, S. M., Nierychlo, M., Kristensen, J. M., Eales, K. L., Grbin, P. R., Wimmer, R. & Nielsen, P. H., 23 maj 2018, I : Frontiers in Microbiology. 9, 12 s., 1004.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil

Global database of microbes in wastewater treatment systems

Bidragets oversatte titel: Global database over mikroorganismer i renseanlægJørgensen, V. R., Dueholm, M. S., Knutsson, S., Nierychlo, M., Kristensen, J. M., Petriglieri, F., Dottorini, G., Yashiro, E., Karst, S. M., Albertsen, M. & Nielsen, P. H., 13 aug. 2018.

Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskriftPosterForskning

activated sludge
gene
bioinformatics
microorganism
wastewater treatment
17 Downloads (Pure)

High-quality draft genome sequence of Sphaerisporangium cinnabarinum ATCC 31213

Christensen, L. F. B., Otzen, D. & Dueholm, M. S., 24 maj 2018, I : Genome Announcements. 6, 21, 2 s., e00456-18.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
Genome
Amyloidogenic Proteins
Amyloid
Bacteria
4 Citationer (Scopus)
71 Downloads (Pure)

Novel prosthecate bacteria from the candidate phylum Acetothermia

Hao, L., McIlroy, S. J., Kirkegaard, R. H., Karst, S. M., Fernando, W. E. Y., Aslan, H., Meyer, R. L., Albertsen, M., Nielsen, P. H. & Dueholm, M. S., 1 sep. 2018, I : ISME Journal. 12, 9, s. 2225-2237 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
formic acid
genome
Nanopores
Metagenome
Genome
24 Citationer (Scopus)
Ribosomal RNA
rRNA Genes
Genes
Ecosystem
Ecosystems
2 Downloads (Pure)

Searching for novel functional amyloids in biofilms

Hove Hansen, S., Danielsen, H. N., Herbst, F-A., Nielsen, P. H. & Dueholm, M. S., 27 maj 2018.

Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskriftPosterForskning

Åben adgang
Fil
2 Citationer (Scopus)
42 Downloads (Pure)

The Sheaths of Methanospirillum Are Made of a New Type of Amyloid Protein

Christensen, L. F. B., Hansen, L. M., Finster, K., Christiansen, G., Nielsen, P. H., Otzen, D. E. & Dueholm, M. S., 13 nov. 2018, I : Frontiers in Microbiology. 9, 11 s., 2729.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
2017
14 Citationer (Scopus)

A new class of hybrid secretion system is employed in Pseudomonas amyloid biogenesis

Rouse, S. L., Hawthorne, W. J., Berry, J-L., Chorev, D. S., Ionescu, S. A., Lambert, S., Stylianou, F., Ewert, W., Mackie, U., Morgan, R. M. L., Otzen, D., Herbst, F-A., Nielsen, P. H., Dueholm, M., Bayley, H., Robinson, C. V., Hare, S. & Matthews, S., 15 aug. 2017, I : Nature Communications. 8, 1, 13 s., 263.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
biological evolution
secretions
pseudomonas
Pseudomonas
Hybrid systems
26 Citationer (Scopus)
39 Downloads (Pure)
Åben adgang
Fil
Sewage
Genome
Chloroflexi
Microbial Consortia
Metagenomics

Direct identification of amyloids by label-free quantitative LC-MS combined with formic acid treatment

Danielsen, H. N., Hansen, S. H., Herbst, F-A., Nielsen, P. H. & Dueholm, M. S., 2017.

Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskriftKonferenceabstrakt til konferenceForskning

5 Citationer (Scopus)
701 Downloads (Pure)

Direct identification of functional amyloid proteins by label-free quantitative mass spectrometry

Danielsen, H. N., Hansen, S. H., Herbst, F-A., Kjeldal, H., Stensballe, A., Nielsen, P. H. & Dueholm, M. S., 4 aug. 2017, I : Biomolecules. 7, 3, 9 s., 58.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Fil
Amyloidogenic Proteins
Amyloid
Mass spectrometry
Labels
Mass Spectrometry
74 Downloads (Pure)
Fil
Ribosomal RNA
Ecology
Databases
Ecosystem
Small Ribosome Subunits

Novel prosthecate bacteria from the candidate phylum Acetothermia revealed by culture-independent genomics and advanced microscopy

Hao, L., McIlroy, S. J., Kirkegaard, R. H., Karst, S. M., Warnakulasuriya, E. Y. F., Aslan, H., Meyer, R. L., Albertsen, M., Nielsen, P. H. & Dueholm, M. S., 2017, I : bioRxiv. 207811.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

Åben adgang

Read error correction of oxford nanopore reads using molecular tagging

Kirkegaard, R. H., Karst, S. M., Dueholm, M. S., Nielsen, P. H. & Albertsen, M., 2017.

Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskriftKonferenceabstrakt til konferenceForskning

21 Citationer (Scopus)
Åben adgang
2016
77 Downloads (Pure)
Fil
morphotype
activated sludge
genome
nitrous oxide
nitrite

Amyloids – a neglected child of the slime

Dueholm, M. S. & Nielsen, P. H., 2016, The Perfect Slime: Microbial Extracellular Polymeric Substances (EPS). Flemming, H-C., Neu, T. R. & Wingender, J. (red.). London: IWA Publishing, s. 113-133 21 s.

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

31 Citationer (Scopus)

Detection of Pathogenic Biofilms with Bacterial Amyloid Targeting Fluorescent Probe, CDy11

Jun-Young, K., Srikanta, S., Yin-Hoe, Y., Xu, W., Shochat, S. G., Nielsen, P. H., Dueholm, M. S., Otzen, D., Jungyeol, L., Santos, M. M. S. D., Hoong, Y., Nam-Young, K., Sung-Jin, P., Hawyoung, K., Seviour, T., Liang, Y., Givskov, M. & Young-Tae, C., 2016, I : Journal of the American Chemical Society. 138, 1, s. 402-407 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Direct identification of amyloids by label-free quantitative LC-MS

Dueholm, M. S., Danielsen, H. N., Hansen, S. H., Herbst, F-A. & Nielsen, P. H., 19 sep. 2016.

Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskriftPosterForskning

Amyloid
Biofilms
formic acid
Melanocyte-Stimulating Hormones
Quorum Sensing
43 Downloads (Pure)

Direct identification of amyloids by label-free quantitative LC-MS combined with formic acid treatment

Danielsen, H. N., Hansen, S. H., Herbst, F-A., Nielsen, P. H. & Dueholm, M. S., 5 sep. 2016.

Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskriftKonferenceabstrakt til konferenceForskning

Åben adgang
Fil
17 Citationer (Scopus)

Epigallocatechin gallate remodels overexpressed functional amyloids in pseudomonas aeruginosa and increases biofilm susceptibility to antibiotic treatment

Stenvang, M. R., Dueholm, M. S., Vad, B. S., Seviour, T., Zeng, G., Geifman-Shochat, S., Søndergaard, M. T., Christiansen, G., Meyer, R. L., Kjelleberg, S., Nielsen, P. H. & Otzen, D. E., 16 dec. 2016, I : The Journal of Biological Chemistry. 291, 51, s. 26540-26553 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Biofilms
Amyloid
Pseudomonas aeruginosa
Anti-Bacterial Agents
Quorum Sensing
13 Citationer (Scopus)
Åben adgang
Chloroflexi
activated sludge
morphotype
Sewage
genomics
16 Citationer (Scopus)
98 Downloads (Pure)
Åben adgang
Fil
immigration
microbial community
microbial ecology
bacterium
genome

Molecular methods

Karst, S. M., Albertsen, M., Kirkegaard, R. H., Dueholm, M. S. & Nielsen, P. H., 2016, Experimental methods in wastewater treatment. van Loosdrecht, M. C. M., Halkjær Nielsen, P., Lopez-Vazquez, C. M. & Brdjanovic, D. (red.). IWA Publishing, s. 285-324 39 s. (Water Intelligence Online).

Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceedingBidrag til bog/antologiForskningpeer review

13 Citationer (Scopus)

The fungal community changes over time in developing wheat heads

Hertz, M., Ravnborg Jensen, I., Østergaard Jensen, L., Nøhr Thomsen, S., Winde, J., Dueholm, M. S., Sørensen, L. H., Wollenberg, R., Sørensen, H. O., Søndergaard, T. E. & Sørensen, J. L., 2016, I : International Journal of Food Microbiology. 222, s. 30-39 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

immigration
community composition
microbial community
microbial ecology
bacterium

The Tubular Sheaths Encasing Methanosaeta and Methanospirillum Filaments are Functional Amyloids

Dueholm, M. S., Larsen, P., Nielsen, P. H., Finster, K., Stenvang, M. R., Christiansen, G. & Otzen, D., 24 aug. 2016.

Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskriftKonferenceabstrakt til konferenceForskning

Amyloid
formic acid
Proteolysis
Depolymerization
Denaturation
2015
3 Citationer (Scopus)

Complete Genome Sequence of the Bacterium Aalborg_AAW-1, Representing a Novel Family within the Candidate Phylum SR1

Dueholm, M. S., Albertsen, M., Stokholm-Bjerregaard, M., McIlroy, S. J., Karst, S. M. & Nielsen, P. H., 15 jun. 2015, I : Genome Announcements. 3, 3, 2 s., e00624-15.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Genome
Bacteria
rRNA Genes
34 Citationer (Scopus)

Functional Amyloids Keep Quorum-sensing Molecules in Check

Seviour, T., Hansen, S. H., Yang, L., Yau, Y. H., Wang, V. B., Stenvang, M. R., Christiansen, G., Marsili, E., Givskov, M., Chen, Y., Otzen, D. E., Nielsen, P. H., Geifman-Shochat, S., Kjelleberg, S. & Dueholm, M. S., 6 mar. 2015, I : Journal of Biological Chemistry. 290, 10, s. 6457-6469 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

41 Citationer (Scopus)

Functional bacterial amyloid increases Pseudomonas biofilm hydrophobicity and stiffness

Zeng, G., Vad, B. S., Dueholm, M. S., Christiansen, G., Nilsson, M., Tolker-Nielsen, T., Nielsen, P. H., Meyer, R. L. & Otzen, D., 2015, I : Frontiers in Microbiology. 6, 1099.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang

Genome based analysis of a novel Chloroflexi in full-scale anaerobic digesters treating waste activated sludge

McIlroy, S. J., Kirkegaard, R. H., Albertsen, M., Dueholm, M. S., Karst, S. M. & Nielsen, P. H., 19 nov. 2015.

Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskriftKonferenceabstrakt til konferenceForskningpeer review

Chloroflexi
Sewage
Genome
8 Citationer (Scopus)

Label-free Quantification Reveals Major Proteomic Changes in Pseudomonas putida F1 During the Exponential Growth Phase

Herbst, F-A., Danielsen, H. N., Wimmer, R., Nielsen, P. H. & Dueholm, M. S., sep. 2015, I : Proteomics. 15, 18, s. 3244-3252 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Pseudomonas putida
Proteomics
Labels
Proteome
Growth
17 Citationer (Scopus)

Major Proteomic Changes Associated with Amyloid-Induced Biofilm Formation in Pseudomonas aeruginosa PAO1

Herbst, F-A., Søndergaard, M. T., Kjeldal, H., Stensballe, A., Nielsen, P. H. & Dueholm, M. S., 2015, I : Journal of Proteome Research. 14, 1, s. 72-81 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Biofilms
Amyloid
Proteomics
Pseudomonas aeruginosa
Pseudomonas

Stabilization and de-stabilization of (membrane-)proteins by microbial glycolipid and lipopeptide biosurfactants - in-vivo relevance and industrial applications

Andersen, K. K., Vad, B. S., Stenvang, M. R., Dueholm, M. S., Nielsen, P. H. & Otzen, D., 27 jan. 2015, I : Biophysical Journal. 108, 2, s. 521a-522a 2 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
18 Citationer (Scopus)

Survival and activity of individual bioaugmentation strains

Dueholm, M. S., G. Marquesa, I., Karst, S. M., D'Imperiob, S., Tale, V. P., Lewis, D., Nielsen, P. H. & Nielsen, J. L., 1 jun. 2015, I : Bioresource Technology. 186, s. 192-199 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

15 Citationer (Scopus)

The Tubular Sheaths Encasing Methanosaeta thermophila Filaments Are Functional Amyloids

Dueholm, M. S., Larsen, P., Finster, K., Stenvang, M. R., Christiansen, G., Vad, B. S., Bøggild, A., Otzen, D. E. & Nielsen, P. H., 14 aug. 2015, I : Journal of Biological Chemistry. 290, 33, s. 20590-20600 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

Åben adgang
Amyloid
Archaea
Proteolysis
Amyloidogenic Proteins
Depolymerization
2014
8 Citationer (Scopus)

Complete Genome of Rhodococcus pyridinivorans SB3094, a Methyl-Ethyl-Ketone-Degrading Bacterium Used for Bioaugmentation

Dueholm, M. S., Albertsen, M., D'Imperio, S., Tale, V. P., Lewis, D., Nielsen, P. H. & Nielsen, J. L., 2014, I : Genome Announcements. 2, 3, e00525-14.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

Åben adgang
Rhodococcus
Genome
Bacteria
Hydrocarbons
Waste Water
7 Citationer (Scopus)

Complete Genome Sequence of Actinobaculum schaalii Strain CCUG 27420

Kristiansen, R., Dueholm, M. S., Bank, S., Nielsen, P. H., Karst, S. M., Cattoir, V., Lienhard, R., Grisold, A. J., Olsen, A. B., Reinhard, M., Søby, K. M., Christensen, J. J., Prag, J. & Thomsen, T. R., 2014, I : Genome Announcements. 2, 5, e00880-14.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

Åben adgang
Urinary Tract
Virulence
Genome
6 Citationer (Scopus)

Complete Genome Sequence of Pseudomonas sp. UK4, a Model Organism for Studies of Functional Amyloids in Pseudomonas

Dueholm, M. S., Danielsen, H. N. & Nielsen, P. H., 2014, I : Genome Announcements. 2, 5, e00898-14.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

Åben adgang
Pseudomonas
Amyloid
Genome
Bacteria
13 Citationer (Scopus)
Åben adgang
Toluene
Pseudomonas
Benzene
Bacteriophages
Genome
2013
24 Citationer (Scopus)

Evolutionary Insight into the Functional Amyloids of the Pseudomonads

Dueholm, M. S., Otzen, D. & Nielsen, P. H., 2013, I : P L o S One. 8, 10, 9 s., e76630.

Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningpeer review

amyloid
Biofilms
Amyloid
biofilm
Genes