Personlig profil
Forskningsprofil
Microbial communities underpin all processes in the environment and have a direct impact on all aspects of our ecosystem and health. This is also reflected in the fact that microbes will be instrumental to reach all 17 sustainable development goals set out by the United Nations. Despite their importance, only a tiny fraction of the millions of different microbes is known.
My research group focus on enabling high-throughput investigation of uncultivated microbes in complex environments using DNA sequencing by developing new methods that increase throughput at least 10-fold. Our mission is to populate the tree-of-life with genomes for the benefit of humanity.
Undervisningsprofil
Course responsible for Data Science a 5 ECTS semester course for 4th and 6th-semester students on Biotechnology, Biology and Chemistry.
Teaching on 7th-semester Biotechnology courses Bioinformatics and Genomics and Environmental Microbiology. Furthermore teaching semester groups 15 ETCS on 7th-semester Biotechnology under the theme of molecular methods.
Emneord
- Kemi og Biovidenskab
- Datalogi
- Folkesundhedsvidenskab
Fingerprint
- 1 Lignende profiler
Samarbejde i de sidste fem år
-
NanoEat: Exploiting Nanopore sequencing to discover what microbes eat
Albertsen, M. (PI (principal investigator)) & Bøjer, J. S. (Projektdeltager)
01/01/2023 → 31/12/2026
Projekter: Projekt › Forskning
-
Microflora Danica: The Microbiome of Denmark
Albertsen, M. (PI (principal investigator)), Nielsen, P. H. (PI (principal investigator)), Jensen, T. B. N. (Projektdeltager), Sørensen, E. A. (Projektdeltager), Sereika, M. (Projektdeltager), Dottorini, G. (Projektdeltager), Petriglieri, F. (Projektdeltager), Jørgensen, V. R. (Projektdeltager), Kirkegaard, R. H. (Projektdeltager), Yang, Y. (Projektdeltager), Karst, S. M. (Projektdeltager), Giguere, A. T. (Projektdeltager), Knutsson, S. (Projektdeltager), Singleton, C. M. (Projektdeltager), Dueholm, M. K. D. (Projektdeltager), Mølvang Dall, S. (Projektdeltager), Kristensen, J. M. (Projektdeltager), Delogu, F. (Projektdeltager), Rodriguez Rojas, M. (PI (principal investigator)) & Kale, V. (Projektdeltager)
01/01/2019 → 31/12/2025
Projekter: Projekt › Forskning
-
DarkScience: Illuminating microbial dark matter through data science
Albertsen, M. (PI (principal investigator)), Hose, K. (PI (principal investigator)), Nielsen, T. D. (PI (principal investigator)), Heidelbach, S. (Projektdeltager), Knudsen, K. S. (Projektdeltager), Sereika, M. (Projektdeltager), Corfixen, M. (Projektdeltager), Celikkanat, A. (Projektdeltager), Masegosa, A. (Projektdeltager), Sagi, T. (Projektdeltager), Nissen, J. (Projektdeltager), Heede, T. (Projektdeltager) & Kirkegaard, R. H. (Projektdeltager)
01/11/2022 → …
Projekter: Projekt › Forskning
-
SepSeq: Development of Nanopore metagenomic DNA-sequencing for bloodstream infection diagnostics
Albertsen, M. (PI (principal investigator)), Eneberg, M. (Projektdeltager), Krarup, A. L. (CoPI), Nielsen, H. L. (CoPI), Eskildsen, A. M. F. (Projektdeltager) & Karst, S. M. (Projektdeltager)
Hartmann Fonden, Danmarks Frie Forskningsfond, Danish E-infrastructure coorperation, Harboefonden, Beckett-Fonden, Direktør Jakob Madsens og Hustru Olga Madsens Fond, Grosserer L.F. Foghts Fond, Torben og Alice Frimodts Fond
01/09/2021 → …
Projekter: Projekt › Forskning
-
Forståelse af smitteveje gennem sekventering og analyse af coronavirus genomer
Albertsen, M. (PI (principal investigator)) & Krarup, H. B. (CoI (co-investigator))
Uddannelses- og Forskningsministeriet, Poul Due Jensens Fond
01/04/2020 → 31/03/2021
Projekter: Projekt › Forskning
-
Oxford Nanopore R10.4 long-read sequencing enables the generation of near-finished bacterial genomes from pure cultures and metagenomes without short-read or reference polishing
Sereika, M., Kirkegaard, R. H., Karst, S. M., Yssing Michaelsen, T., Sørensen, E. A., Wollenberg, R. D. & Albertsen, M., 4 jul. 2022, I: Nature Methods. 19, 7, s. 823-826 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Formidling
Åben adgangFil312 !!Link opens in a new tab Citationer (Scopus)210 Downloads (Pure) -
High-accuracy long-read amplicon sequences using unique molecular identifiers with Nanopore or PacBio sequencing
Karst, S. M., Ziels, R. M., Kirkegaard, R. H., Sørensen, E. A., McDonald, D., Zhu, Q., Knight, R. & Albertsen, M., feb. 2021, I: Nature Methods. 18, 2, s. 165-169 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
273 !!Link opens in a new tab Citationer (Scopus) -
Connecting structure to function with the recovery of over 1000 high-quality metagenome-assembled genomes from activated sludge using long-read sequencing
Singleton, C. M., Petriglieri, F., Kristensen, J. M., Kirkegaard, R. H., Michaelsen, T. Y., Andersen, M. H., Kondrotaite, Z., Karst, S. M., Dueholm, M. S., Nielsen, P. H. & Albertsen, M., 31 mar. 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 13 s., 2009.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil248 !!Link opens in a new tab Citationer (Scopus)327 Downloads (Pure) -
Complete nitrification by Nitrospira bacteria
Daims, H., Lebedeva, E. V., Pjevac, P., Han, P., Herbold, C., Albertsen, M., Jehmlich, N., Palatinszky, M., Vierheilig, J., Bulaev, A., Kirkegaard, R. H., von Bergen, M., Rattei, T., Bendinger, B., Nielsen, P. H. & Wagner, M., 24 dec. 2015, I: Nature. 528, 7583, s. 504-509 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
2336 !!Link opens in a new tab Citationer (Scopus) -
Genome sequences of rare, uncultured bacteria obtained by differential coverage binning of multiple metagenomes
Albertsen, M., Hugenholtz, P., Skarshewski, A., Nielsen, K. L., Tyson, G. W. & Nielsen, P. H., 26 maj 2013, I: Nature Biotechnology. 31, s. 533-538 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
1003 !!Link opens in a new tab Citationer (Scopus)
Forskningsdatasæt
-
Study protocol for "Application of rapid Nanopore metagenomic cell-free DNA sequencing to diagnose bloodstream infections: a prospective observational study"
Nielsen, M. E. (Ophavsperson), Nielsen, H. L. (Ophavsperson) & Albertsen, M. (Vejleder), medRxiv, 15 maj 2024
DOI: 10.1101/2024.05.09.24307053
Datasæt: Supplerende materiale
Fil -
Introduction and transmission of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7, Alpha variant, in Denmark
Michaelsen, T. Y. (Ophavsperson), Bennedbæk, M. (Ophavsperson), Christiansen, L. E. (Ophavsperson), Jørgensen, M. S. F. (Ophavsperson), Møller, C. H. (Ophavsperson), Sørensen, E. A. (Ophavsperson), Knutsson, S. (Ophavsperson), Brandt, J. (Ophavsperson), Jensen, T. B. N. (Ophavsperson), Chiche-Lapierre, C. E. (Ophavsperson), Collados, E. F. (Ophavsperson), Sørensen, T. (Ophavsperson), Petersen, C. (Ophavsperson), Le-Quy, V. (Ophavsperson), Sereika, M. (Ophavsperson), Hansen, F. T. (Ophavsperson), Rasmussen, M. (Ophavsperson), Fonager, J. (Ophavsperson), Karst, S. M. (Ophavsperson), Marvig, R. L. (Ophavsperson), Stegger, M. (Ophavsperson), Sieber, R. N. (Ophavsperson), Skov, R. (Ophavsperson), Legarth, R. (Ophavsperson), Krause, T. G. (Ophavsperson), Fomsgaard, A. (Ophavsperson) & Albertsen, M. (Ophavsperson), Figshare, 4 maj 2022
DOI: 10.6084/m9.figshare.c.5978621, https://springernature.figshare.com/collections/Introduction_and_transmission_of_SARS-CoV-2_lineage_B_1_1_7_Alpha_variant_in_Denmark/5978621
Datasæt
-
Additional file 2 of Introduction and transmission of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7, Alpha variant, in Denmark
Michaelsen, T. Y. (Ophavsperson), Bennedbæk, M. (Ophavsperson), Christiansen, L. E. (Ophavsperson), Jørgensen, M. S. F. (Ophavsperson), Møller, C. H. (Ophavsperson), Sørensen, E. A. (Ophavsperson), Knutsson, S. (Ophavsperson), Brandt, J. (Ophavsperson), Jensen, T. B. N. (Ophavsperson), Chiche-Lapierre, C. (Ophavsperson), Collados, E. F. (Ophavsperson), Sørensen, T. (Ophavsperson), Petersen, C. (Ophavsperson), Le-Quy, V. (Ophavsperson), Sereika, M. (Ophavsperson), Hansen, F. T. (Ophavsperson), Rasmussen, M. (Ophavsperson), Fonager, J. (Ophavsperson), Karst, S. M. (Ophavsperson), Marvig, R. L. (Ophavsperson), Stegger, M. (Ophavsperson), Sieber, R. N. (Ophavsperson), Skov, R. (Ophavsperson), Legarth, R. (Ophavsperson), Krause, T. G. (Ophavsperson), Fomsgaard, A. (Ophavsperson) & Albertsen, M. (Ophavsperson), Figshare, 4 maj 2022
DOI: 10.6084/m9.figshare.19703921, https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_2_of_Introduction_and_transmission_of_SARS-CoV-2_lineage_B_1_1_7_Alpha_variant_in_Denmark/19703921
Datasæt
-
Clinical results and microbiota changes after faecal microbiota transplantation for chronic pouchitis: a pilot study
Kousgaard, S. J. (Ophavsperson), Michaelsen, T. Y. (Ophavsperson), Nielsen, H. L. (Ophavsperson), Kirk, K. F. (Ophavsperson), Brandt, J. (Ophavsperson), Albertsen, M. (Ophavsperson) & Thorlacius-Ussing, O. (Ophavsperson), Taylor & Francis, 14 apr. 2020
DOI: 10.6084/m9.figshare.12123111, https://tandf.figshare.com/articles/Clinical_results_and_microbiota_changes_after_faecal_microbiota_transplantation_for_chronic_pouchitis_a_pilot_study/12123111
Datasæt: Supplerende materiale
Priser
-
The Fritz Kaufmann Prize, 200.000 DKK
Albertsen, M. (Modtager), Yssing Michaelsen, T. (Modtager), Fomsgaard, A. (Modtager), Rasmussen, M. (Modtager), Fonager, J. (Modtager) & The Danish Covid-19 Genome Consortium (Modtager), 2021
Pris: Forsknings- uddannelses og innovationspriser
-
The Grundfos Prize, 1.000.000 DKK
Albertsen, M. (Modtager), 2021
Pris: Forsknings- uddannelses og innovationspriser
-
The Rising Star award by the IWA & ISME societies
Albertsen, M. (Modtager), 2016
Pris: Forsknings- uddannelses og innovationspriser
-
Research Result of the Year in Denmark, videnskab.dk
Albertsen, M. (Modtager), Nielsen, P. H. (Modtager) & Kirkegaard, R. H. (Modtager), 2015
Pris: Forsknings- uddannelses og innovationspriser
-
The Spar Nord Fond Research Prize, 250.000 DKK
Albertsen, M. (Modtager), 2015
Pris: Forsknings- uddannelses og innovationspriser
Aktiviteter
-
Co-founder and CEO, DNASense ApS
Albertsen, M. (Stifter)
2014 → 2020Aktivitet: Myndighedsbetjening, konsulentarbejde og øvrig ansættelse › Opstart af egen virksomhed
-
Scientific Advisory Board member SciLifeLab, National Genomics Infrastructure, Sweeden
Albertsen, M. (Konsulent)
2022 → …Aktivitet: Myndighedsbetjening, konsulentarbejde og øvrig ansættelse › Myndighedsbetjening
-
Member of the Danish SARS-CoV-2 variant risk-assessment group
Albertsen, M. (Konsulent)
2021 → …Aktivitet: Myndighedsbetjening, konsulentarbejde og øvrig ansættelse › Myndighedsbetjening
-
MicroFlora Danica: Diversity, homogenisation, and the hidden nitrifiers of Denmark’s microbial atlas
Singleton, C. M. (Foredragsholder), Knudsen, K. S. (Foredragsholder), Jensen, T. B. N. (Foredragsholder), Speth, D. R. (Foredragsholder), Delogu, F. (Foredragsholder), Yang, Y. (Foredragsholder), Sereika, M. (Foredragsholder), Mølvang Dall, S. (Foredragsholder), Kirkegaard, R. H. (Foredragsholder), Kristensen, J. M. (Foredragsholder), Woodcroft, B. J. (Foredragsholder), Aroney, S. T. N. (Foredragsholder), Dueholm, M. K. D. (Foredragsholder), Wagner, M. (Foredragsholder), Nielsen, P. H. (Foredragsholder) & Albertsen, M. (Foredragsholder)
23 jun. 2025Aktivitet: Foredrag og mundtlige bidrag › Konferenceoplæg
-
Long-read sequencing, in Master of Personalized Medicine
Albertsen, M. (Foredragsholder)
7 dec. 2022Aktivitet: Foredrag og mundtlige bidrag › Undervisning og kursusvirksomhed ved andre universiteter
Presse/medier
-
Danmark får nyt atlas over naturens usynlige liv
Albertsen, M. & Nielsen, P. H.
17/02/2026
1 element af Mediedækning
Presse/medie
-
-
Storslået og betydningsfuldt: Ingeniøren kårer Danmarks mikroflora-kortlægning som årets største, danske videnskabelige bidrag
Nielsen, P. H. & Albertsen, M.
06/01/2026
1 element af Mediedækning
Presse/medie
-
AAU står bag årets største videnskabelige gennembrud i Danmark
Albertsen, M. & Nielsen, P. H.
25/12/2025 → 27/12/2025
4 elementer af Mediedækning
Presse/medie
-
Nordjysk projekt kåret som "Årets forskningsresultat"
19/12/2025 → 20/12/2025
3 elementer af Mediedækning
Presse/medie
Impacts
-
Overvågning af coronavirussen
Albertsen, M. (Deltager), Sørensen, E. A. (Deltager), Jensen, T. B. N. (Deltager), Sørensen, T. (Deltager), Petersen, C. (Deltager) & Sereika, M. (Deltager)
Impact: Livskvalitets impact
-
Viden om mikroorganismer forbinder kultur og bæredygtighed
Albertsen, M. (Deltager) & Nielsen, P. H. (Deltager)
Impact: Grøn impact, Kulturel impact, Anden impact