Caitlin Margaret Singleton

Publikationer

Publikationer pr. år 2018 2021 2022 2025

• 22 Tidsskriftartikel
• 14 Poster
• 4 Konferenceabstrakt til konference
• 3 Preprint
• 5 Mere
  • 2 Letter
  • 2 Review (oversigtsartikel)
  • 1 Konferenceabstrakt i proceeding

Publikationer pr. år

Publikationer pr. år

Søgeresultater

• 2025

  Diversity and abundance of filamentous and non-filamentous “Leptothrix” in global wastewater treatment plants

  Suazo, K. S., Nierychlo, M., Kondrotaite, Z., Petriglieri, F., Peces, M., Singleton, C., Dries, J. & Nielsen, P. H., 19 mar. 2025, I: Applied and Environmental Microbiology. 91, 3, 17 s., e01485-24.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Leptothrix 100%
  • Leptotrichia Species 50%
  • Ideonella 50%
  • Rubrivivax 50%
  • Filament Morphology 25%
  5 Downloads (Pure)

• Diversity and physiology of abundant Rhodoferax species in global wastewater treatment systems

  Petersen, J. F., Valk, L. C., Verhoeven, M. D., Nierychlo, M. A., Singleton, C. M., Dueholm, M. K. D. & Nielsen, P. H., jan. 2025, I: Systematic and Applied Microbiology. 48, 1, 14 s., 126574.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Biotransformation 100%
  • Phylogenomics 50%
  • Ecophysiology 50%
  • RNA Gene 50%
  • Metagenome 50%
  2 Citationer (Scopus)

  1 Downloads (Pure)

• Proposal of Patescibacterium danicum gen. nov., sp. nov. in the ubiquitous bacterial phylum Patescibacteriota phyl. nov

  Dutkiewicz, Z., Singleton, C. M., Sereika, M., Villada, J. C., Mussig, A. J., Chuvochina, M., Albertsen, M., Schulz, F., Woyke, T., Nielsen, P. H., Hugenholtz, P. & Rinke, C., jan. 2025, I: ISME communications. 5, 1, 11 s., ycae147.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Bacterial Phyla 100%
  • Phylum 100%
  • Phylogenomics 50%
  • Prokaryote 50%
  • Metagenome 50%
  2 Citationer (Scopus)

  2 Downloads (Pure)
• 2024

  The predicted secreted proteome of activated sludge microorganisms indicates distinct nutrient niches

  Wasmund, K., Singleton, C., Dahl Dueholm, M. K., Wagner, M. & Nielsen, P. H., okt. 2024, I: mSystems. 9, 10, 22 s., e00301-24.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Bacteroidota 100%
  • Myxococcota 49%
  • Heme-binding Motifs 25%
  • Polysaccharide Digestion 25%
  • Gemmatimonadota 25%
  2 Citationer (Scopus)

  7 Downloads (Pure)
• 2022

  Diversity and Ecophysiology of the Genus OLB8 and Other Abundant Uncultured Saprospiraceae Genera in Global Wastewater Treatment Systems

  Kondrotaite, Z., Valk, L. C., Petriglieri, F., Singleton, C., Nierychlo, M., Dueholm, M. K. D. & Nielsen, P. H., 8 jul. 2022, I: Frontiers in Microbiology. 13, 917553.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Fluorescence in Situ Hybridization 100%
  • Ecophysiology 100%
  • Macromolecule 50%
  • Polysaccharide 50%
  • MiDAS 50%
  66 Citationer (Scopus)

  206 Downloads (Pure)

• Exploring the microbial influence on seasonal nitrous oxide concentration in a full-scale wastewater treatment plant using metagenome assembled genomes

  Valk, L. C., Peces, M., Singleton, C. M., Laursen, M. D., Andersen, M. H., Mielczarek, A. T. & Nielsen, P. H., jul. 2022, I: Water Research. 219, 118563.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Wastewater Treatment 100%
  • Metagenome 100%
  • Nitrous Oxide 100%
  • Wastewater Treatment Plant 100%
  • Greenhouse Gas 50%
  31 Citationer (Scopus)

  174 Downloads (Pure)

• Long-Read Metagenome-Assembled Genomes Improve Identification of Novel Complete Biosynthetic Gene Clusters in a Complex Microbial Activated Sludge Ecosystem

  Sanchez Navarro, R., Nuhamunada, M., Mohite, O., Wasmund, K., Albertsen, M., Gram, L., Nielsen, P. H., Weber, T. & Singleton, C. M., 29 nov. 2022, I: mSystems. 7, 6, e00632-22.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Metagenome 100%
  • Gene Cluster 100%
  • Metabolite 26%
  • Specialized Metabolites 26%
  • Genetics 13%
  22 Citationer (Scopus)

  80 Downloads (Pure)

• Reevaluation of the Phylogenetic Diversity and Global Distribution of the Genus "Candidatus Accumulibacter"

  Petriglieri, F., Singleton, C. M., Kondrotaite, Z., Dueholm, M. K. D., McDaniel, E. A., McMahon, K. D. & Nielsen, P. H., 28 jun. 2022, I: mSystems. 7, 3, e0001622.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Polyphosphate Accumulating Organisms 100%
  • Candidatus Accumulibacter 100%
  • Phylogenetic Diversity 100%
  • Global Distribution 100%
  • Diversity Distribution 100%
  36 Citationer (Scopus)

  232 Downloads (Pure)

• The novel genus, ‘Candidatus Phosphoribacter’, previously identified as Tetrasphaera, is the dominant polyphosphate accumulating lineage in EBPR wastewater treatment plants worldwide

  Singleton, C. M., Petriglieri, F., Wasmund, K., Nierychlo, M., Kondrotaite, Z., Petersen, J. F., Peces, M., Dueholm, M. S., Wagner, M. & Nielsen, P. H., jun. 2022, I: ISME Journal. 16, 6, s. 1605-1616 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Species Diversity 100%
  • Dermatophilaceae 75%
  • Phosphorus Cycle 42%
  67 Citationer (Scopus)

  99 Downloads (Pure)
• 2021

  Connecting structure to function with the recovery of over 1000 high-quality metagenome-assembled genomes from activated sludge using long-read sequencing

  Singleton, C. M., Petriglieri, F., Kristensen, J. M., Kirkegaard, R. H., Michaelsen, T. Y., Andersen, M. H., Kondrotaite, Z., Karst, S. M., Dueholm, M. S., Nielsen, P. H. & Albertsen, M., 31 mar. 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 13 s., 2009.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Metagenome 100%
  • Amplicon Sequencing 40%
  • Lineages 20%
  • Fluorescence in Situ Hybridization 20%
  • RNA Gene 20%
  209 Citationer (Scopus)

  242 Downloads (Pure)

• Diverse sediment microbiota shape methane emission temperature sensitivity in Arctic lakes

  Emerson, J. B., Varner, R. K., Wik, M., Parks, D. H., Neumann, R. B., Johnson, J. E., Singleton, C. M., Woodcroft, B. J., Tollerson, R., Owusu-Dommey, A., Binder, M., Freitas, N. L., Crill, P. M., Saleska, S. R., Tyson, G. W. & Rich, V. I., dec. 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 5815.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Emission Temperature 100%
  • Sediment Microbiome 100%
  • Arctic Lakes 100%
  • Methane 100%
  • Emissions 100%
  26 Citationer (Scopus)

  57 Downloads (Pure)

• High Diversity and Functional Potential of Undescribed “Acidobacteriota” in Danish Wastewater Treatment Plants

  Kristensen, J. M., Singleton, C. M., Clegg, L.-A., Petriglieri, F. & Nielsen, P. H., 22 apr. 2021, I: Frontiers in Microbiology. 12, 14 s., 643950.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Lineages 100%
  • Acidobacteriota 100%
  • Fluorescence in Situ Hybridization 66%
  • Taxon 66%
  • Amplicon Sequencing 33%
  89 Citationer (Scopus)

  183 Downloads (Pure)

• Low Global Diversity of Candidatus Microthrix, a Troublesome Filamentous Organism in Full-Scale WWTPs

  Nierychlo, M., Singleton, C. M., Petriglieri, F., Thomsen, L., Petersen, J. F., Peces, M., Kondrotaite, Z., Dueholm, M. S. & Nielsen, P. H., 25 jun. 2021, I: Frontiers in Microbiology. 12, 16 s., 690251.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Wastewater Treatment 100%
  • Genetic Similarity 20%
  • Versatile Metabolism 20%
  • Municipal Wastewater 14%
  • Nitrite 14%
  28 Citationer (Scopus)

  96 Downloads (Pure)

• Parasitic bacteria control foam formation

  Nielsen, P. H. & Singleton, C. M., jun. 2021, I: Nature Microbiology. 6, 6, s. 701-702 2 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Rådgivning › peer review
  2 Citationer (Scopus)

• “Candidatus Dechloromonas phosphoritropha” and “Ca. D. phosphorivorans”, novel polyphosphate accumulating organisms abundant in wastewater treatment systems

  Petriglieri, F., Singleton, C., Peces, M., Petersen, J. F., Nierychlo, M. & Nielsen, P. H., dec. 2021, I: ISME Journal. 15, 12, s. 3605-3614 10 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Polyphosphate Accumulating Organisms 100%
  • Wastewater Treatment System 100%
  • Dechloromonas 100%
  • Candidatus 100%
  • Enhanced Biological Phosphorus Removal 50%
  119 Citationer (Scopus)

  69 Downloads (Pure)
• 2020

  Connecting structure to function with the recovery of over 1000 high-quality activated sludge metagenome-assembled genomes encoding full-length rRNA genes using long-read sequencing

  Singleton, C. M., Petriglieri, F., Kristensen, J. M., Kirkegaard, R. H., Yssing Michaelsen, T., Andersen, M. H., Kondrotaite, Z., Karst, S. M., Dueholm, M. S., Nielsen, P. H. & Albertsen, M., 12 maj 2020, I: bioRxiv.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning

  Åben adgang

• Novel syntrophic bacteria in full-scale anaerobic digesters revealed by genome-centric metatranscriptomics

  Hao, L., Yssing Michaelsen, T., Singleton, C. M., Dottorini, G., Kirkegaard, R. H., Albertsen, M., Nielsen, P. H. & Dueholm, M. S., 2 jan. 2020, I: ISME Journal. 14, 4, s. 906-918 13 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Syntrophic Bacteria 100%
  • Metagenome 100%
  • Transcriptomics 50%
  • Fatty Acid Oxidation 50%
  • Functional Guilds 25%
  136 Citationer (Scopus)

  112 Downloads (Pure)

• The signal and the noise: Characteristics of antisense RNA in complex microbial communities

  Michaelsen, T. Y., Brandt, J., Singleton, C. M., Kirkegaard, R. H., Wiesinger, J., Segata, N. & Albertsen, M., 11 feb. 2020, I: mSystems. 5, 1, e00587-19.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil

  • Antisense RNA 100%
  • Gene Expression 100%
  • Antisense 100%
  • Complementary RNA 100%
  • Antisense Expression 83%
  2 Citationer (Scopus)

  70 Downloads (Pure)

• “Candidatus Dechloromonas phosphatis” and “Candidatus Dechloromonas phosphovora”, two novel polyphosphate accumulating organisms abundant in wastewater treatment systems

  Petriglieri, F., Singleton, C. M., Gomez, M. P., Petersen, J. F., Nierychlo, M. A. & Nielsen, P. H., 2020, I: bioRxiv.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning

  • Dechloromonas 100%
  • Fluorescence in Situ Hybridization 37%
  • Metagenome 25%
  • Dynamics 12%
  • 16S Ribosomal RNA 12%
• 2019

  Discovery and ecogenomic context of a global Caldiserica-related phylum active in thawing permafrost, Candidatus Cryosericota phylum nov., Ca. Cryosericia class nov., Ca. Cryosericales ord. nov., Ca. Cryosericaceae fam. nov., comprising the four species Cryosericum septentrionale gen. nov. sp. nov., Ca. C. hinesii sp. nov., Ca. C. odellii sp. nov., Ca. C. terrychapinii sp. nov.

  IsoGenie Project Coordinators, jan. 2019, I: Systematic and Applied Microbiology. 42, 1, s. 54-66 13 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  • Caldiserica 100%
  • Ecogenomics 100%
  • Community Dominance 12%
  • Sulfur-reducing 12%
  • Adaptation to Low Temperature 12%
  20 Citationer (Scopus)
• 2018

  Genome-centric view of carbon processing in thawing permafrost

  Woodcroft, B. J., Singleton, C. M., Boyd, J. A., Evans, P. N., Emerson, J. B., Zayed, A. A. F., Hoelzle, R. D., Lamberton, T. O., McCalley, C. K., Hodgkins, S. B., Wilson, R. M., Purvine, S. O., Nicora, C. D., Li, C., Frolking, S., Chanton, J. P., Crill, P. M., Saleska, S. R., Rich, V. I. & Tyson, G. W., 2 aug. 2018, I: Nature. 560, 7716, s. 49-54 6 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Lineages 100%
  • Thawing Permafrost 100%
  • Metagenomics 50%
  • Phylum 50%
  • Metagenome 50%
  286 Citationer (Scopus)

• Methanotrophy across a natural permafrost thaw environment

  Singleton, C. M., McCalley, C. K., Woodcroft, B. J., Boyd, J. A., Evans, P. N., Hodgkins, S. B., Chanton, J. P., Frolking, S., Crill, P. M., Saleska, S. R., Rich, V. I. & Tyson, G. W., 1 okt. 2018, I: ISME Journal. 12, 10, s. 2544-2558 15 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  • Permafrost Thaw 100%
  • Methanotrophy 100%
  • Palsa 16%
  • Hyphomicrobiaceae 14%
  • Stordalen Mire 12%
  103 Citationer (Scopus)