Projekter pr. år
Personlig profil
Forskningsprofil
Microbial life is everywhere impacting everything from planetary processes to human health. Understanding the microbial communities driving these processes are vital for reaching a sustainable future, yet most bacteria are still to be discovered, known as the microbial dark matter.
I focus on analyzing bacterial communities with metagenomics and machine learning to improve human health and illuminate the microbial dark matter by improving the recovery of bacterial genomes.
Uddannelse (Akademiske kvalifikationer)
Bioteknologi, CANDIDATUS POLYTECHNICES (CAND.POLYT.), Vigtigheden af taksonomisk klassificeringssoftware og maskinlæringsalgoritmer for prædiktionen af kolorektal cancer, Center for Microbial Communities
1 sep. 2019 → 25 okt. 2021
Dimissionsdato: 25 okt. 2021
Bioteknologi, BACHELOR (BSC) I TEKNISK VIDENSKAB, Cyclodextringlycosyltransferase Catalysed Transglycosylation of Alkylglycosides, Institut for Kemi og Biovidenskab
1 sep. 2016 → 21 jun. 2019
Dimissionsdato: 21 jun. 2019
Emneord
- Kemi og Biovidenskab
- DNA sequencing
- Metagenomics
- Bacteria
- Colorectal Cancer
- Oxford Nanopore
- Illumina
- Public Health
- Diagnostics
- SARS-CoV-2 sequencing
- Machine Learning
- High-performance computing
Fingerprint
Fingerprint er automatisk genererede koncepter, som stammer fra personprofilernes indhold. Det opdateres løbende med nye registreringer.
- 1 Lignende profiler
Samarbejde i de sidste fem år
Klik på punkterne for at se detaljerne.
Projekter
- 2 Afsluttet
-
Data Science meets Microbial Dark Matter
Albertsen, M. (PI (principal investigator)), Hose, K. (PI (principal investigator)), Nielsen, T. D. (PI (principal investigator)), Lamurias, A. (Projektdeltager) & Mølvang Dall, S. (Projektdeltager)
Danish E-infrastructure Cooperation, Villum Fonden
01/01/2021 → 31/12/2023
Projekter: Projekt › Forskning
-
Microflora Danica: The Microbiome of Denmark
Albertsen, M. (PI (principal investigator)), Nielsen, P. H. (PI (principal investigator)), Jensen, T. B. N. (Projektdeltager), Sørensen, E. A. (Projektdeltager), Sereika, M. (Projektdeltager), Dottorini, G. (Projektdeltager), Petriglieri, F. (Projektdeltager), Jørgensen, V. R. (Projektdeltager), Kirkegaard, R. H. (Projektdeltager), Yang, Y. (Projektdeltager), Karst, S. M. (Projektdeltager), Giguere, A. T. (Projektdeltager), Knutsson, S. (Projektdeltager), Singleton, C. M. (Projektdeltager), Dueholm, M. K. D. (Projektdeltager), Mølvang Dall, S. (Projektdeltager), Kristensen, J. M. (Projektdeltager), Delogu, F. (Projektdeltager), Rodriguez Rojas, M. (PI (principal investigator)) & Kale, V. (Projektdeltager)
01/01/2019 → 31/12/2025
Projekter: Projekt › Forskning
-
The Importance of Taxonomic Classification Software and Machine Learning Algorithms for the Prediction of Colorectal Cancer
Bidragets oversatte titel :Vigtigheden af taksonomisk klassificeringssoftware og machine learning algoritmer for prædiktion af kolorektal cancer Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskrift › Poster › Forskning
Åben adgangFil29 Downloads (Pure) -
Exploring the Danish nitrifiers in MicroFlora Danica, Denmark’s microbial atlas
Singleton, C. M., Jensen, T. B., Knudsen, K. S., Speth, D. R., Delogu, F., Yang, Y., Sereika, M., Mølvang Dall, S., Kirkegaard, R. H., Kristensen, J. M., Woodcroft, B. J., Aroney, S. T. N., Dueholm, M. K. D., Wagner, M., Nielsen, P. H. & Albertsen, M., 10 nov. 2025.Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskrift › Poster › Forskning
-
Fecal microbiota transplantation from a healthy pouch donor for chronic pouchitis: a proof-of-concept study
Kousgaard, S. J., Dall, S. M., Albertsen, M., Nielsen, H. L. & Thorlacius-Ussing, O., 2025, I: Gut Microbes. 17, 1, 9 s., 2510464.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang1 Citationer (Scopus) -
MicroFlora Danica: Searching for Nitrifiers across 10,683 Danish samples
Knudsen, K. S., Singleton, C. M., Jensen, T. B., Speth, D. R., Delogu, F., Yang, Y., Sereika, M., Mølvang Dall, S., Kirkegaard, R. H., Kristensen, J. M., Woodcroft, B. J., Aroney, S., Dueholm, M. K. D., Wagner, M., Nielsen, P. H. & Albertsen, M., 23 jun. 2025.Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskrift › Poster › Forskning
Fil2 Downloads (Pure) -
The Microflora Danica atlas of Danish environmental microbiomes
Singleton, C., Jensen, T., Delogu, F., Knudsen, K., Sørensen, E., Jørgensen, V., Karst, S., Yang, Y., Sereika, M., Petriglieri, F., Knutsson, S., Dall, S., Kirkegaard, R., Kristensen, J., Overgaard, C. K., Woodcroft, B., Speth, D., Aroney, S., The Microflora Danica Consortium & Pedersen, I. S. (Medlem af forfattergruppering) & 8 flere, , 3 dec. 2025, (E-pub ahead of print) I: Nature. 40 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgang
Aktiviteter
- 1 Konferenceoplæg
-
MicroFlora Danica: Diversity, homogenisation, and the hidden nitrifiers of Denmark’s microbial atlas
Singleton, C. M. (Foredragsholder), Knudsen, K. S. (Foredragsholder), Jensen, T. B. N. (Foredragsholder), Speth, D. R. (Foredragsholder), Delogu, F. (Foredragsholder), Yang, Y. (Foredragsholder), Sereika, M. (Foredragsholder), Mølvang Dall, S. (Foredragsholder), Kirkegaard, R. H. (Foredragsholder), Kristensen, J. M. (Foredragsholder), Woodcroft, B. J. (Foredragsholder), Aroney, S. T. N. (Foredragsholder), Dueholm, M. K. D. (Foredragsholder), Wagner, M. (Foredragsholder), Nielsen, P. H. (Foredragsholder) & Albertsen, M. (Foredragsholder)
23 jun. 2025Aktivitet: Foredrag og mundtlige bidrag › Konferenceoplæg