Trine Rolighed Thomsen

Publikationer

Publikationer pr. år 2001 2005 2006 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2018 2024

• 59 Tidsskriftartikel
• 34 Poster
• 28 Konferenceabstrakt i proceeding
• 23 Konferenceabstrakt til konference
• 14 Mere
  • 5 Bidrag til bog/antologi
  • 2 Konferenceartikel i proceeding
  • 2 Konferenceabstrakt i tidsskrift
  • 1 Paper uden forlag/tidsskrift
  • 1 Konferenceartikel i tidsskrift
  • 1 Letter
  • 1 Review (oversigtsartikel)
  • 1 Ph.d.-afhandling

Publikationer pr. år

Publikationer pr. år

Søgeresultater

• 2011

  Functional bacterial amyloids in biofilms

  Nielsen, P. H., Dueholm, M. S., Thomsen, T. R., Nielsen, J. L. & Otzen, D., 2011, Biofilm Highlights, Springer Series on Biofilms. Flemming, H.-C., Szewzyk, U. & Wingender, J. (red.). Berlin: Springer, Bind 5. s. 41-62 22 s.

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceeding › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

• Influence of Microorganisms on the Healing of Skin Grafts from Chronic Venous Leg Wounds, Skin Grafts - Indications, Applications and Current Research

  Wolff, T. Y., Bjarnsholt, T., Kirketerp-Møller, K. & Thomsen, T. R., 2011, Skin Grafts - Indications, Applications and Current Research. Spear, M. (red.). INTECH

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceeding › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

• The fight against biofilm infections: Do we have the knowledge and means?

  Kirketerp-Møller, K., Bjarnsholt, T. & Thomsen, T. R., maj 2011, I: EWMA Journal. 11, 2, s. 8-9 2 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

• The role of bacterial biofilms in infections of catheters and shunts

  Thomsen, T. R., Hall-Stoodley, L., Moser, C. & Stoodley, P., 2011, Biofilm Infections. Springer, s. 91-109 19 s.

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceeding › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

  • Biofilms 100%
  • Urinary Catheter 50%
  • Drain Fluid 50%
  • Ventricular Shunt 50%
  • Intravascular Catheter 50%
  9 Citationer (Scopus)

• True Microbiota Involved in Chronic Lung Infection of Cystic Fibrosis Patients Found by Culturing and 16S rRNA Gene Analysis

  Rudkjøbing, V. B., Thomsen, T. R., Alhede, M., Kragh, K. N., Nielsen, P. H., Johansen, U. R., Givskov, M., Høiby, N. & Bjarnsholt, T., 2011, I: Journal of Clinical Microbiology. 49, 12, s. 4352-4355 4 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  31 Citationer (Scopus)
• 2010

  Biofilms in chronic infections – a matter of opportunity- Monospecies biofilms in multispecies infections

  Burmølle, M., Thomsen, T. R., Fazli, M., Dige, I., Christensen, L., Homøe, P., Tvede, M., Nyvad, B., Tolker-Nielsen, T., Givskov, M., Moser, C. E., Kirketerp-Møller, K., Johansen, H. K., Høiby, N., Jensen, P. Ø., Sørensen, S. J. & Bjarnsholt, T., 2010, I: F E M S Immunology and Medical Microbiology. 59, 3, s. 324-336 13 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  333 Citationer (Scopus)

• Detection of microorganisms involved in airway infection of cystic fibrosis patients by standard culturing & molecular methods

  Rudkjøbing, V. B., Thomsen, T. R., Nielsen, P. H., Alhede, M., Johansen, U. R., Høiby, N. & Bjarnsholt, T., 2010, I: Pediatric Pulmonology. Suppl. 33, s. 347-348 2 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › peer review

• Detection of microorganisms involved in airway infection of cystic fibrosis patients by standard culturing and molecular methods

  Rudkjøbing, V. B., Nielsen, P. H., Johansen, U., Høiby, N., Thomsen, T. R. & Bjarnsholt, T., 2010. 1 s.

  Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskrift › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

  Fil
  172 Downloads (Pure)

• Detection of microorganisms involved in airway infection of cystic fibrosis patients by standard culturing and molecular methods

  Rudkjøbing, V. B., Thomsen, T. R., Nielsen, P. H., Alhede, M., Johansen, U., Høiby, N. & Bjarnsholt, T., 2010. 1 s.

  Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskrift › Poster › Forskning

  Fil
  121 Downloads (Pure)

• Identification and Quantification fo Bacteria in Prosthetic Joint Specimens by Molecular Methods

  Xu, Y., Rudkjøbing, V. B., Simonsen, O. H., Pedersen, C., Schønheyder, H. C., Nielsen, P. H. & Thomsen, T. R., 2010. 1 s.

  Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskrift › Poster › Forskning

  Fil
  125 Downloads (Pure)

• Microbial communities in different biofilm related infections

  Thomsen, T. R., Wolff, T. Y., Rudkjøbing, V. B., Xu, Y., Nielsen, P. H., Bjarnsholt, T., Høiby, N. & Moser, C. E., 2010. 1 s.

  Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskrift › Poster › Forskning

  Fil
  128 Downloads (Pure)

• Microbial communities in different biofilm related infections

  Thomsen, T. R., Wolff, T. Y., Rudkjøbing, V. B., Xu, Y., Nielsen, P. H., Bjarnsholt, T., Høiby, N. & Moser, K., 1 sep. 2010, Biofilms IV Communities bridging disiplines, pages 1-94, Soutjhampton, UK. Biofilms4 international conference. 1-3 September, 2010. Winchester, UK, Bind 17. s. 36-36 1 s.

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceeding › Konferenceabstrakt i proceeding › Forskning

  Fil
  193 Downloads (Pure)

• Når bakterier skal afsløres hurtigt

  Wolff, T. Y., Nielsen, P. H., Moser, C. & Thomsen, T. R., 2010, I: Aktuel Naturvidenskab. s. 28-31 4 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

• The bacteriology of chronic venous leg ulcer examined by culture-independent molecular methods

  Thomsen, T. R., Aasholm, M. S., Rudkjøbing, V. B., Saunders, A. M., Bjarnsholt, T., Givskov, M., Kirketerp-Møller, K. & Nielsen, P. H., 2010, I: Wound Repair and Regeneration. 18, s. 38-49 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  120 Citationer (Scopus)
• 2009

  Practical use of new microbiology tools in oil production

  Skovhus, T. L., Højris, B., Saunders, A. M., Thomsen, T. R., Agerbœk, M. & Larsen, J., 1 feb. 2009, I: SPE Production and Operations. 24, 1, s. 180-186 7 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Microbial 100%
  • Oil Production 100%
  • Gel Electrophoresis 100%
  • Powerful Tool 33%
  • Fluorescence in Situ Hybridization 33%
  15 Citationer (Scopus)
• 2008

  Diagnosis of central-venous catheter colonizations using cultivation-dependent and -independent techniques

  Larsen, M. K. S., Thomsen, T. R., Moser, C., Høiby, N. & Nielsen, P. H., 28 okt. 2008, I: BMC Clinical Pathology. 8, 10

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

• Identification and ecophysiological characterization of epiphytic protein-hydrolyzing Saprospiraceae (Candidatus epiflobacter spp.) in activated sludge

  Xia, Y., Kong, Y., Thomsen, T. R. & Nielsen, P. H., 2008, I: Applied and Environmental Microbiology. 74, 74, s. 2229-2238 10 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  178 Citationer (Scopus)

• Identity, abundance and ecophysiology of filamentous bacteria belonging to the Bacteroidetes present in activated sludge plants

  Kragelund, C., Levantesi, C., Borger, A., Thelen, K., Eikelboom, D., Tandoi, V., Kong, Y., Krooneman, J., Larsen, P., Thomsen, T. R. & Nielsen, P. H., 2008, I: Microbiology. 154, 3, s. 886-894

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  92 Citationer (Scopus)

• Identity, abundance and ecophysiology of filamentous Chloroflexi species from activated sludge treatment plants

  Kragelund, C., Levantesi, C., Borger, A., Thelen, K., Tandoi, V., Eikelboom, D., Kong, Y., van der Werde, J., Krooneman, J., Rossetti, S., Thomsen, T. R. & Nielsen, P. H., 2008, I: FEMS Microbiology Ecology. 59, 3, s. 671-681 10 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

• Use of cultivation-dependent and -independent techniques to assess contamination of central venous catheters: A pilot study

  Larsen, M. K. S., Thomsen, T. R., Moser, C., Høiby, N. & Nielsen, P. H., 2008, I: BMC Clinical Pathology. 8, 10

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  26 Citationer (Scopus)
• 2007

  Diversity of sulfate-reducing bacteria from an extreme hypersaline sediment, Great Salt Lake (Utah)

  Kjeldsen, K. U., Loy, A., Jakobsen, T. F., Thomsen, T. R., Wagner, M. & Ingvorsen, K., 1 maj 2007, I: FEMS Microbiology Ecology. 60, 2, s. 287-298 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Hypersaline Sediment 100%
  • Desulfohalobium 33%
  • Gene-based 16%
  • Moderate Halophile 16%
  • DsrB Gene 16%
  114 Citationer (Scopus)

• Ecophysiology of abundant denitrifying bacteria in activated sludge

  Thomsen, T. R., Kong, Y. & Nielsen, P. H., 2007, I: FEMS Microbiology Ecology. 60, 3, s. 370-382 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  209 Citationer (Scopus)

• Ecophysiology of foaming Mycolata in activated sludge

  Kragelund, C., Eales, K., Nielsen, J. L., Carr, E. L., Thomsen, T. R., Seviour, E. M., Nielsen, P. H. & Seviour, R. J., 2007.

  Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskrift › Poster › Forskning

• Ecophysiology of mycolic acid-containing Actinobacteria (Mycolata) in activated sludge foams

  Kragelund, C., Remesova, Z., Nielsen, J. L., Thomsen, T. R., Eales, K., Seviour, R., Wanner, J. & Nielsen, P. H., 2007, I: FEMS Microbiology Ecology. 61, 1, s. 174-184 10 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  61 Citationer (Scopus)

• Practical use of new microbiology tools in oil production

  Skovhus, T. L., Højris, B., Saunders, A. M., Thomsen, T. R., Agerbæk, M. & Larsen, J., 1 jan. 2007, Society of Petroleum Engineers - Offshore Europe Oil and Gas Conference and Exhibition 2007. Society of Petroleum Engineers (SPE), s. 646-653 8 s.

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceeding › Konferenceartikel i proceeding › Forskning › peer review

  • Gel Electrophoresis 100%
  • Reducing Bacteria 100%
  • Oil Production 100%
  • MPN Technique 100%
  • Fast Response 50%
  13 Citationer (Scopus)

• Practical use of new microbiology tools in oil production

  Skovhus, T. L., Højris, B., Saunders, A. M., Thomsen, T. R., Agerbæk, M. & Larsen, J., 2007, Society of Petroleum Engineers - Offshore Europe Oil and Gas Conference and Exhibition 2007. Society of Petroleum Engineers (SPE), s. 646-653 8 s. (SPE Offshore Europe Conference Proceedings).

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceeding › Konferenceartikel i proceeding › Forskning › peer review

  • Oil Production 100%
  • Oil Field 100%
  • Bacterial Population 100%
  • Microbiology 100%
  • Corrosion 100%
• 2006

  Bacterial diversity study applying novel molecular methods on halfdan produced waters

  Larsen, J., Skovhus, T. L., Agerbæk, M., Thomsen, T. R. & Nielsen, P. H., 1 dec. 2006, I: NACE - International Corrosion Conference Series. s. 66681-666822 600142 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel i tidsskrift › Forskning › peer review

  • Produced Water 100%
  • Sulfate Reducing Archaeon 100%
  • Gel Electrophoresis 100%
  • Retardation 50%
  • Fluorescence in Situ Hybridization 50%
  22 Citationer (Scopus)

• Culture-dependent and culture-independent diversity of halophilic sulfate-reducing prokaryotes from an extreme hypersaline sediment in Great Salt Lake (Utah, USA)

  Kjeldsen, K. U., Loy, A., Thomsen, T. R., Jakobsen, T. F., Wagner, M. & Ingvorsen, K., 2006, 11th International Symposium on Microbial Ecology, ISME-11: Book of Anbstracts. s. A 371

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceeding › Konferenceabstrakt i proceeding › Forskning

• Culture-dependent and culture-independent diversity of halophilic sulfate-reducing prokaryotes from an extreme hypersaline sediment in Great Salt Lake (Utah, USA)

  Kjeldsen, K. U., Loy, A., Thomsen, T. R., Jakobsen, T. F., Wagner, M. & Ingvorsen, K., 2006.

  Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskrift › Poster › Forskning

• Ecophysiology of different filamentous Alphaproteobacteria in industrial wastewater treatment plants

  Kragelund, C., Kong, Y., van der Waarde, J., Thelen, K., Eikelboom, D., Tandoi, V., Thomsen, T. R. & Nielsen, P. H., 2006, I: Microbiology. 152, pt 10, s. 3003-3012 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  52 Citationer (Scopus)

• Ecophysiology of five filamentous Alphaproteobacteria from industrial wastewater treatment plants

  Kragelund, C., Kong, Y., van der Waarde, J., Thelen, K., Eikelboom, D., Tandoi, V., Thomsen, T. R. & Nielsen, P. H., 2006, I: Microbiology. 152, s. 3003-3012 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

• Floc-forming properties of polyphosphate accumulating organisms in activated sludge

  Larsen, P., Eriksen, P. S., Lou, M. A., Thomsen, T. R., Kong, Y., Nielsen, J. L. & Nielsen, P. H., 2006, I: Water Science and Technology. 54, 1, s. 257-265

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  15 Citationer (Scopus)

• Identification and quantification of microorganisms on medical devices using culture-independent molecular methods

  Thomsen, T. R., Nielsen, M. K., Moser, C., Højby, N. & Nielsen, P. H., 2006, 11th International Symposium on Microbial Ecology, ISME-11: Book of Abstracts. s. A 96

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceeding › Konferenceabstrakt i proceeding › Forskning

• Identification and quantification of microorganisms on medical devices using culture-independent molecular methods

  Thomsen, T. R., Nielsen, M. K., Moser, C., Højby, N. & Nielsen, P. H., 2006.

  Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskrift › Poster › Forskning

• Identity, abundance and physiology of Aquaspirillum-related filamentous bacteria in activated sludge

  Thomsen, T. R., Kragelund, C. & Nielsen, P. H., 2006, I: Water Science and Technology. 54, 1, s. 237-245

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  14 Citationer (Scopus)

• Importance of media and polymer constituents for biofilm growth in medical devices

  Thomsen, U. & Thomsen, T. R., 2006.

  Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskrift › Poster › Forskning

• Importance of media and polymer constituents for biofilm growth in medical devices

  Thomsen, U. & Thomsen, T. R., 2006, 11th International Symposium on Microbial Ecology, ISME-11: Book of Abstracts. s. A 95

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceeding › Konferenceabstrakt i proceeding › Forskning
• 2005

  Ecophysiology of bacteria involved in N- and P-removal in full-scale activated sludge plants

  Nielsen, P. H., Thomsen, T. R., Kong, Y. & Nielsen, J. L., 2005, 12th European Congress on Biotechnology, ECB 12. Bind 118. s. 163 1 s. ( Journal of Biotechnology).

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceeding › Konferenceabstrakt i proceeding › Forskning

• Ecophysiology of the filamentous Alphaproteobacterium Meganema perideroedes in activated sludge

  Kragelund, C., Nielsen, J. L., Thomsen, T. R. & Nielsen, P. H., 1 sep. 2005, I: FEMS Microbiology Ecology. 54, 1, s. 111-122 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  • Activated Sludge 100%
  • Ecophysiology 100%
  • Alphaproteobacteria 100%
  • Aerobic Conditions 50%
  • Surface Property 33%
  80 Citationer (Scopus)

• Ecophysiology of the filamentous Alphaproteobaeterium Meganema perideroedes in activated sludge

  Kragelund, C., Nielsen, J. L., Thomsen, T. R. & Nielsen, P. H., 2005, I: FEMS Microbiology Ecology. 54, 1, s. 111-122 11 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

• Floc-forming properties of polyphosphate accumulating organisms in activated sludge

  Larsen, P., Eriksen, P. S., Lou, M. A., Thomsen, T. R., Kong, Y., Nielsen, J. L. & Nielsen, P. H., 2005, 4th IWA SPD Specialist Conference: Program and Abstracts.

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceeding › Konferenceabstrakt i proceeding › Forskning

• Identity, abundance and physiology of Aquaspirillumrelated filamentous bacteria in activated sludge

  Thomsen, T. R., Kragelund, C. & Nielsen, P. H., 2005.

  Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskrift › Paper uden forlag/tidsskrift › Forskning › peer review

• Microbial diversity in biofilms from corroding heating systems

  Kjellerup, B. V., Thomsen, T. R., Nielsen, J. L., Olsen, B. H., Frølund, B. & Nielsen, P. H., 2005, I: Biofouling. 21, 1, s. 19-29

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  19 Citationer (Scopus)

• Monitoring of microbial souring in chemically treated, produced-water biofilm systems using molecular techniques

  Kjellerup, B. V., Veeh, R., Sumithraratne, P., Thomsen, T. R., Buckingham-Meyer, K., Frolund, B. & Sturman, P., 2005, I: Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology. 32, 4, s. 163-170 7 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  51 Citationer (Scopus)

• Population structure and ecophysiology of microbial populations in full-scale activated sludge treatment plants

  Nielsen, P. H., Nielsen, J. L., Kong, Y., Kragelund, C., Thomsen, T. R. & Morgan, F., 2005.

  Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskrift › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

• Structure and function of denitrifying populations in alternating oxic and anoxic systems: Co-existens of few specialized and versatile populations

  Nielsen, P. H., Thomsen, T. R., Kong, Y., Nielsen, J. L., Kragelund, C. & Morgan, F., 2005.

  Publikation: Konferencebidrag uden forlag/tidsskrift › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

• The ecosystem activated sludge: Carbon flow and structure-function of the microbial populations.

  Nielsen, P. H., Nielsen, J. L., Kong, Y., Kragelund, C., Thomsen, T. R. & Morgan, F., 2005, 4th IWA SPD Specialist Conference:  Program and Abstracts. IWA Publishing

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceeding › Konferenceabstrakt i proceeding › Forskning
• 2004

  Bacterial composition of activated sludge: importance for floc and sludge properties

  Nielsen, P. H., Thomsen, T. R. & Nielsen, J. L., 2004, I: Water Science and Technology. 49, 49, s. 51-58

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  63 Citationer (Scopus)

• Comparative sequence analysis of dissimilatory sulfite reductase (DSR) genes and 16S rRNA genes of uncultivated sulphate reducers

  Nielsen, J. L., Thomsen, T. R., Thorsen, M. & Nielsen, P. H., 2004, Book of abstracts ISME 10.

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport/konference proceeding › Konferenceabstrakt i proceeding › Forskning

• Micromanipulation and further identification of FISH-labelled microcolonies of a dominant denitrifying bacterium in activated sludge

  Thomsen, T. R., Nielsen, J. L., Ramsing, N. B. & Nielsen, P. H., 2004, I: Environmental Microbiology. 6, 5, s. 470-479

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  57 Citationer (Scopus)