FLUORESCENCE GUIDED IDENTIFICATION OF NOVEL ANTIBIOTICS

Projektdetaljer

Beskrivelse

Hver år dør mere end 25.000 mennesker i Europa på grund af infektioner med multiresistente bakterier der ikke længere kan bekæmpes med de nuværende lægemidler. Det er derfor nødvendigt at udvikle nye antibiotika og det er oplagt at finde disse i skimmelsvampe da de har et stort genetisk potentiale til at lave bioaktive stoffer. Dette potentiale bliver dog langt fra forløst i laboratoriet, hvor kun ~20-25 % af de ansvarlige gener kan knyttes til et produkt. Dette skyldes at de ansvarlige gener er slukkede og vil kun blive aktiveret under særlige forhold. De slukkede gener kan aktiveres ved at udsætte svampene for forskellige vækstbetingelser eller genetisk manipulation, hvorefter svampenes metabolome, transcriptome eller proteome typisk vil blive undersøgt med tidskrævende og omkostningsfulde metoder. For at undgå denne flaskehals vil jeg udvikle en fluorescensplatform til at visualisere hvornår de slukkede gener bliver tændt i to skimmelsvampe, Fusarium graminearum og F. solani. Denne metode vil tillade at et næsten uendeligt stort antal forhold kan blive undersøgt, hvorved de aktiverede forhold vil blive identificeret. Nye stoffer vil blive isoleret ved at dyrke svampene under disse forhold, hvorefter stofferne vil blive testet for antibiotisk effekt imod et panel af relevante bakterier. På denne måde vil projektet tilvejebringe nye stoffer med antibiotisk effekt der har potentiale til at bekæmpe multiresistente baktier.
StatusAfsluttet
Effektiv start/slut dato01/07/201330/06/2016