Forståelse af smitteveje gennem sekventering og analyse af coronavirus genomer

Albertsen, Mads (PI (principal investigator))
Krarup, Henrik Bygum (CoI (co-investigator))

Beskrivelse

Projektet vil udvikle og implementere metoder, der muliggør hurtig fuld-genom sekventering af coronavirusprøver patientnært regionalt og nationalt og at sikre, at sekvensinformation kobles med klinisk og epidemiologisk viden som beslutningsstøtte for offentlige myndigheder.

Lægmandssprog

Forskere fra Aalborg Universitet, Aalborg Universitetshospital, Hvidovre Hospital og Statens Serum Institut er i gang med at analysere coronavirussens arvemateriale. Professor MSO Mads Albertsen fra Institut for Kemi og Biovidenskab på Aalborg Universitet udtaler i en pressemeddelelse i den sammenhæng, at DNA-analyser af coronavirussens genomer kan føre til viden om, hvordan virussen spreder sig, såvel som udviklingen af vacciner.

Status	Afsluttet
Effektiv start/slut dato	01/04/2020 → 31/03/2021

Samarbejdspartnere

Aalborg Universitetshospital
Hvidovre Hospital, Hvidovre
Statens Serum Institut

Finansiering

Poul Due Jensens Fond: 4.251.213,00 kr.
Uddannelses- og Forskningsministeriet: 5.000.000,00 kr.

7 Gæsteforelæsning
3 Konferenceoplæg
2 Foredrag og præsentationer i privat eller offentlig virksomhed
1 Myndighedsbetjening

Enabling real-time monitoring of human pathogens and biodiversity through DNA sequencing
Mads Albertsen (Foredragsholder)
25 okt. 2022
Aktivitet: Foredrag og mundtlige bidrag › Konferenceoplæg
A brief history of SARS-CoV-2 sequencing in Denmark
Mads Albertsen (Oplægsholder)
2 sep. 2022
Aktivitet: Foredrag og mundtlige bidrag › Konferenceoplæg
A brief history of SARS-CoV-2 sequencing in Denmark
Mads Albertsen (Oplægsholder)
3 jun. 2022
Aktivitet: Foredrag og mundtlige bidrag › Gæsteforelæsning

Overvågning af coronavirussen
Mads Albertsen (Deltager), Emil Aarre Sørensen (Deltager), Thomas Bygh Nymann Jensen (Deltager), Trine Sørensen (Deltager), Celine Petersen (Deltager) & Mantas Sereika (Deltager)
Impact: Livskvalitets impact

5 Tidsskriftartikel

SpikeSeq: A rapid, cost efficient and simple method to identify SARS-CoV-2 variants of concern by Sanger sequencing part of the spike protein gene
Jørgensen, T. S., Pedersen, M. S., Blin, K., Kuntke, F., Salling, H. K., Marvig, R. L., Michaelsen, T. Y., Albertsen, M. & Larsen, H., feb. 2023, I: Journal of Virological Methods. 312, 114648.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang
Fil
1 Downloads (Pure)
Introduction and transmission of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7, Alpha variant, in Denmark
Michaelsen, T. Y., Bennedbæk, M., Christiansen, L. E., Jørgensen, M. S. F., Møller, C. H., Sørensen, E. A., Knutsson, S., Brandt, J., Jensen, T. B. N., Chiche-Lapierre, C., Collados, E. F., Sørensen, T., Petersen, C., Le-Quy, V., Sereika, M., Hansen, F. T., Rasmussen, M., Fonager, J., Karst, S. M., Marvig, R. L., & 70 flereStegger, M., Sieber, R. N., Skov, R., Legarth, R., Krause, T. G., Fomsgaard, A., The Danish COVID-19 Genome Consortium (DCGC), Andersen, K. S., Andersen, M. H., Berg, A., Bielidt, S. R., Dall, S. M., Dvarionaite, E., Hansen, S. H., Jørgensen, V. R., Kirkegaard, R. H., Saei, W., Nicolajsen, T. B., Østergaard, S. K., Brøndum, R. F., Bøgsted, M., Hose, K., Sagi, T., Pakanec, M., Fuglsang-Damgaard, D., Mølvadgaard, M., Krarup, H., Svarrer, C. W., Christiansen, M. T., Ingham, A. C., Johannesen, T. B., Basterrechea, M., Lilje, B., Ellegaard, K., Matusevicius, P., Christoffersen, L. B., Tang, M. H. E., Ng, K. L., Edslev, S. M., Baig, S., Larsen, O. H., Skipper, K. A., Vang, S., Handberg, K. J., Nielsen, M. T. K., Kobel, C. M., Andersen, C., Tarpgaard, I. H., Ellermann-Eriksen, S., Castruita, J. A. S., Schneider, U. V., Jacobsen, N. G., Andersen, C., Pedersen, M. S., Schønning, K., Kirkby, N., Nielsen, L., Nilsson, L. L., Friis, M. B., Sundelin, T., Hansen, T. A., Skov, M. N., Sydenham, T. V., Nielsen, X. C., Schouw, C. H., Jensen, A., Marmolin, E. S., Coia, J. E., Andersen, D. T. & Albertsen, M., 4 maj 2022, I: Genome Medicine. 14, 1, 47.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang
Fil
3 Citationer (Scopus)

9 Downloads (Pure)
Hospitalisation associated with SARS-CoV-2 delta variant in Denmark
Bager, P., Wohlfahrt, J., Rasmussen, M., Albertsen, M. & Krause, T. G., okt. 2021, I: The Lancet Infectious Diseases. 21, 10, s. 1351 1 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Åben adgang

35 Citationer (Scopus)

"Jeg har altid mit sekventeringsapparat med i tasken"
Mads Albertsen & Per Halkjær Nielsen
10/12/2021
1 element af Mediedækning
Presse/medie
»Vi ser småbørn med så alvorlige symptomer, at de skal indlægges«
Mads Albertsen
03/12/2021 → 05/12/2021
3 elementer af Mediedækning
Presse/medie
Omikron frygtes at være mere smitsom end Delta
Mads Albertsen
01/12/2021
2 elementer af Mediedækning
Presse/medie

Forståelse af smitteveje gennem sekventering og analyse af coronavirus genomer

Projektdetaljer

Beskrivelse

Lægmandssprog

Samarbejdspartnere

Finansiering

Fingerprint

Enabling real-time monitoring of human pathogens and biodiversity through DNA sequencing

A brief history of SARS-CoV-2 sequencing in Denmark

A brief history of SARS-CoV-2 sequencing in Denmark

Overvågning af coronavirussen

SpikeSeq: A rapid, cost efficient and simple method to identify SARS-CoV-2 variants of concern by Sanger sequencing part of the spike protein gene

Introduction and transmission of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7, Alpha variant, in Denmark

Hospitalisation associated with SARS-CoV-2 delta variant in Denmark

"Jeg har altid mit sekventeringsapparat med i tasken"

»Vi ser småbørn med så alvorlige symptomer, at de skal indlægges«

Omikron frygtes at være mere smitsom end Delta

Forståelse af smitteveje gennem sekventering og analyse af coronavirus genomer

Projektdetaljer

Beskrivelse

Lægmandssprog

Samarbejdspartnere

Finansiering

Fingerprint

Aktiviteter

Impacts

Publikation

Presse/medier