Abstract
Breast cancer (BC) risk for BRCA1 and BRCA2 mutation carriers varies by genetic and familial factors. About 50 common variants have been shown to modify BC risk for mutation carriers. All but three, were identified in general population studies. Other mutation carrier-specific susceptibility variants may exist but studies of mutation carriers have so far been underpowered. We conduct a novel case-only genome-wide association study comparing genotype frequencies between 60,212 general population BC cases and 13,007 cases with BRCA1 or BRCA2 mutations. We identify robust novel associations for 2 variants with BC for BRCA1 and 3 for BRCA2 mutation carriers, P < 10−8, at 5 loci, which are not associated with risk in the general population. They include rs60882887 at 11p11.2 where MADD, SP11 and EIF1, genes previously implicated in BC biology, are predicted as potential targets. These findings will contribute towards customising BC polygenic risk scores for BRCA1 and BRCA2 mutation carriers.
| Originalsprog | Engelsk |
|---|---|
| Artikelnummer | 1078 |
| Tidsskrift | Nature Communications |
| Vol/bind | 12 |
| Udgave nummer | 1 |
| Antal sider | 22 |
| ISSN | 2041-1723 |
| DOI | |
| Status | Udgivet - feb. 2021 |
Bibliografisk note
Korrektion er udgivet online 17 February 2021:Coignard, J., Lush, M., Beesley, J. et al. Author Correction: A case-only study to identify genetic modifiers of breast cancer risk for BRCA1/BRCA2 mutation carriers. Nat Commun 12, 2986 (2021). https://doi-org.auh.aub.aau.dk/10.1038/s41467-021-23162-4.
"The original version of this Article contained an error in the spelling of the author Heiko Becher, which was incorrectly given as Heko Becher. This has now been corrected in both the PDF and HTML versions of the Article."
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- Coignard et al (2021) A case-only study to identify genetic modifiers of breast cancer risk for BRCA1_BRCA2 mutation carriersForlagets udgivne version, 3,64 MBLicens: CC BY 4.0
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I: Nature Communications, Bind 12, Nr. 1, 1078, 02.2021.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
TY - JOUR
T1 - A case-only study to identify genetic modifiers of breast cancer risk for BRCA1/BRCA2 mutation carriers
AU - Coignard, Juliette
AU - Lush, Michael
AU - Beesley, Jonathan
AU - O’Mara, Tracy A.
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AU - EMBRACE Collaborators
AU - kConFab Investigators
AU - HEBON Investigators
AU - ABCTB Investigators
N1 - A Correction to this paper has been published online 17 February 2021: Coignard, J., Lush, M., Beesley, J. et al. Author Correction: A case-only study to identify genetic modifiers of breast cancer risk for BRCA1/BRCA2 mutation carriers. Nat Commun 12, 2986 (2021). https://doi-org.auh.aub.aau.dk/10.1038/s41467-021-23162-4. "The original version of this Article contained an error in the spelling of the author Heiko Becher, which was incorrectly given as Heko Becher. This has now been corrected in both the PDF and HTML versions of the Article."
PY - 2021/2
Y1 - 2021/2
N2 - Breast cancer (BC) risk for BRCA1 and BRCA2 mutation carriers varies by genetic and familial factors. About 50 common variants have been shown to modify BC risk for mutation carriers. All but three, were identified in general population studies. Other mutation carrier-specific susceptibility variants may exist but studies of mutation carriers have so far been underpowered. We conduct a novel case-only genome-wide association study comparing genotype frequencies between 60,212 general population BC cases and 13,007 cases with BRCA1 or BRCA2 mutations. We identify robust novel associations for 2 variants with BC for BRCA1 and 3 for BRCA2 mutation carriers, P < 10−8, at 5 loci, which are not associated with risk in the general population. They include rs60882887 at 11p11.2 where MADD, SP11 and EIF1, genes previously implicated in BC biology, are predicted as potential targets. These findings will contribute towards customising BC polygenic risk scores for BRCA1 and BRCA2 mutation carriers.
AB - Breast cancer (BC) risk for BRCA1 and BRCA2 mutation carriers varies by genetic and familial factors. About 50 common variants have been shown to modify BC risk for mutation carriers. All but three, were identified in general population studies. Other mutation carrier-specific susceptibility variants may exist but studies of mutation carriers have so far been underpowered. We conduct a novel case-only genome-wide association study comparing genotype frequencies between 60,212 general population BC cases and 13,007 cases with BRCA1 or BRCA2 mutations. We identify robust novel associations for 2 variants with BC for BRCA1 and 3 for BRCA2 mutation carriers, P < 10−8, at 5 loci, which are not associated with risk in the general population. They include rs60882887 at 11p11.2 where MADD, SP11 and EIF1, genes previously implicated in BC biology, are predicted as potential targets. These findings will contribute towards customising BC polygenic risk scores for BRCA1 and BRCA2 mutation carriers.
UR - http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=85101270098&partnerID=8YFLogxK
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M3 - Journal article
C2 - 33990587
AN - SCOPUS:85101270098
SN - 2041-1723
VL - 12
JO - Nature Communications
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