Project Details

Description

For nylig er der markedsført to revolutionerende DNA-sekventerings teknologier, der sekventerer 450.000 (454 Life Sciences) og 40 mio (Solexa) genstumper ad gangen i stedet for normalt 96-384. Det betyder at en kørsel på en sådan maskine kan anvendes til individorienteret diagnostik, eller til analyse af komplekse mikrobiologiske samfund, f.eks. i mave-tarm kanalen, på overflader af medicinske katedre og implantater, eller omkring rødderne på planter. Analyser og tolkning af sådanne data sæt kræver en ny form for bioinformatiske værktøjer. I dette projekt samarbejder en række universiteter, der har anskaffet disse maskiner, Aalborg Sygehus og bioinformatik firmaet CLC bio om at generere data og analysere disse. Vi vil gennem projektet udvikle en samlet programpakke baseret på CLC bio’s ’Workbench’, som gennem en brugervenlig grafisk brugerflade vil tillade at data fra stor-skala DNA sekventeringsprojekter kan analyseres effektivt i ikke-specialiserede laboratorier hos private virksomheder eller private og offentlige forskningsinstitutioner.

StatusFinished
Effective start/end date01/01/200831/12/2013

Funding

  • Det Strategiske Forskningsråd - Nabiit: DKK7,963,030.00
  • Det Strategiske Forskningsråd - Nabiit